Protein–RNA interactions for Protein: Q86YS3

RAB11FIP4, Rab11 family-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP4Q86YS3 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RAB11FIP4Q86YS3 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RAB11FIP4Q86YS3 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RAB11FIP4Q86YS3 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RAB11FIP4Q86YS3 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RAB11FIP4Q86YS3 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RAB11FIP4Q86YS3 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RAB11FIP4Q86YS3 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
RAB11FIP4Q86YS3 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RAB11FIP4Q86YS3 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RAB11FIP4Q86YS3 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RAB11FIP4Q86YS3 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
RAB11FIP4Q86YS3 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
RAB11FIP4Q86YS3 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
RAB11FIP4Q86YS3 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
RAB11FIP4Q86YS3 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
RAB11FIP4Q86YS3 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
RAB11FIP4Q86YS3 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
RAB11FIP4Q86YS3 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
RAB11FIP4Q86YS3 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RAB11FIP4Q86YS3 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RAB11FIP4Q86YS3 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RAB11FIP4Q86YS3 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RAB11FIP4Q86YS3 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RAB11FIP4Q86YS3 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RAB11FIP4Q86YS3 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
RAB11FIP4Q86YS3 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RAB11FIP4Q86YS3 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RAB11FIP4Q86YS3 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RAB11FIP4Q86YS3 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RAB11FIP4Q86YS3 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RAB11FIP4Q86YS3 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RAB11FIP4Q86YS3 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RAB11FIP4Q86YS3 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RAB11FIP4Q86YS3 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RAB11FIP4Q86YS3 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RAB11FIP4Q86YS3 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
RAB11FIP4Q86YS3 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RAB11FIP4Q86YS3 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RAB11FIP4Q86YS3 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RAB11FIP4Q86YS3 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RAB11FIP4Q86YS3 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RAB11FIP4Q86YS3 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RAB11FIP4Q86YS3 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RAB11FIP4Q86YS3 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RAB11FIP4Q86YS3 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RAB11FIP4Q86YS3 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RAB11FIP4Q86YS3 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RAB11FIP4Q86YS3 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RAB11FIP4Q86YS3 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RAB11FIP4Q86YS3 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RAB11FIP4Q86YS3 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RAB11FIP4Q86YS3 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RAB11FIP4Q86YS3 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RAB11FIP4Q86YS3 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RAB11FIP4Q86YS3 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RAB11FIP4Q86YS3 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RAB11FIP4Q86YS3 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
RAB11FIP4Q86YS3 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RAB11FIP4Q86YS3 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RAB11FIP4Q86YS3 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RAB11FIP4Q86YS3 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RAB11FIP4Q86YS3 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RAB11FIP4Q86YS3 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RAB11FIP4Q86YS3 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RAB11FIP4Q86YS3 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RAB11FIP4Q86YS3 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RAB11FIP4Q86YS3 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RAB11FIP4Q86YS3 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RAB11FIP4Q86YS3 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RAB11FIP4Q86YS3 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RAB11FIP4Q86YS3 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
RAB11FIP4Q86YS3 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RAB11FIP4Q86YS3 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RAB11FIP4Q86YS3 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RAB11FIP4Q86YS3 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RAB11FIP4Q86YS3 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RAB11FIP4Q86YS3 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
RAB11FIP4Q86YS3 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
RAB11FIP4Q86YS3 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
RAB11FIP4Q86YS3 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC26.33■■□□□ 1.81
RAB11FIP4Q86YS3 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC26.33■■□□□ 1.81
RAB11FIP4Q86YS3 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RAB11FIP4Q86YS3 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RAB11FIP4Q86YS3 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
RAB11FIP4Q86YS3 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
RAB11FIP4Q86YS3 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RAB11FIP4Q86YS3 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RAB11FIP4Q86YS3 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RAB11FIP4Q86YS3 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
RAB11FIP4Q86YS3 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
RAB11FIP4Q86YS3 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RAB11FIP4Q86YS3 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
RAB11FIP4Q86YS3 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
RAB11FIP4Q86YS3 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RAB11FIP4Q86YS3 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RAB11FIP4Q86YS3 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
RAB11FIP4Q86YS3 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RAB11FIP4Q86YS3 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
RAB11FIP4Q86YS3 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms