Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT8

CCDC84, Coiled-coil domain-containing protein 84, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC84Q86UT8 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC84Q86UT8 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC84Q86UT8 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC84Q86UT8 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC84Q86UT8 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC84Q86UT8 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC84Q86UT8 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC84Q86UT8 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC84Q86UT8 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC84Q86UT8 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC84Q86UT8 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC84Q86UT8 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC84Q86UT8 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC84Q86UT8 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC84Q86UT8 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC84Q86UT8 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC84Q86UT8 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC84Q86UT8 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC84Q86UT8 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC84Q86UT8 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC84Q86UT8 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC84Q86UT8 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC84Q86UT8 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC84Q86UT8 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC84Q86UT8 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC84Q86UT8 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC84Q86UT8 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC84Q86UT8 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC84Q86UT8 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC84Q86UT8 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC84Q86UT8 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC84Q86UT8 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC84Q86UT8 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC84Q86UT8 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC84Q86UT8 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC84Q86UT8 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC84Q86UT8 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC84Q86UT8 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC84Q86UT8 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC84Q86UT8 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC84Q86UT8 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
CCDC84Q86UT8 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CCDC84Q86UT8 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CCDC84Q86UT8 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC84Q86UT8 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC84Q86UT8 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC84Q86UT8 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC84Q86UT8 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC84Q86UT8 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC84Q86UT8 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC84Q86UT8 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC84Q86UT8 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC84Q86UT8 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC84Q86UT8 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC84Q86UT8 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC84Q86UT8 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC84Q86UT8 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC84Q86UT8 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC84Q86UT8 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC84Q86UT8 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC84Q86UT8 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC84Q86UT8 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC84Q86UT8 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC84Q86UT8 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC84Q86UT8 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC84Q86UT8 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC84Q86UT8 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC84Q86UT8 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC84Q86UT8 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC84Q86UT8 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC84Q86UT8 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC84Q86UT8 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC84Q86UT8 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC84Q86UT8 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC84Q86UT8 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC84Q86UT8 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC84Q86UT8 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC84Q86UT8 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC84Q86UT8 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC84Q86UT8 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC84Q86UT8 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC84Q86UT8 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC84Q86UT8 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC84Q86UT8 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC84Q86UT8 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC84Q86UT8 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC84Q86UT8 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC84Q86UT8 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC84Q86UT8 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC84Q86UT8 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC84Q86UT8 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC84Q86UT8 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC84Q86UT8 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC84Q86UT8 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC84Q86UT8 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC84Q86UT8 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC84Q86UT8 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC84Q86UT8 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC84Q86UT8 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC84Q86UT8 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms