Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z6E9

RBBP6, E3 ubiquitin-protein ligase RBBP6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,792 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP6Q7Z6E9 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RBBP6Q7Z6E9 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RBBP6Q7Z6E9 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RBBP6Q7Z6E9 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RBBP6Q7Z6E9 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RBBP6Q7Z6E9 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RBBP6Q7Z6E9 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RBBP6Q7Z6E9 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RBBP6Q7Z6E9 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RBBP6Q7Z6E9 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RBBP6Q7Z6E9 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RBBP6Q7Z6E9 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RBBP6Q7Z6E9 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RBBP6Q7Z6E9 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RBBP6Q7Z6E9 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RBBP6Q7Z6E9 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RBBP6Q7Z6E9 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RBBP6Q7Z6E9 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RBBP6Q7Z6E9 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RBBP6Q7Z6E9 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RBBP6Q7Z6E9 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RBBP6Q7Z6E9 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RBBP6Q7Z6E9 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RBBP6Q7Z6E9 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RBBP6Q7Z6E9 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
RBBP6Q7Z6E9 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RBBP6Q7Z6E9 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RBBP6Q7Z6E9 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RBBP6Q7Z6E9 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RBBP6Q7Z6E9 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RBBP6Q7Z6E9 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RBBP6Q7Z6E9 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RBBP6Q7Z6E9 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RBBP6Q7Z6E9 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RBBP6Q7Z6E9 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RBBP6Q7Z6E9 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RBBP6Q7Z6E9 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RBBP6Q7Z6E9 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RBBP6Q7Z6E9 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RBBP6Q7Z6E9 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
RBBP6Q7Z6E9 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RBBP6Q7Z6E9 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RBBP6Q7Z6E9 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RBBP6Q7Z6E9 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
RBBP6Q7Z6E9 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RBBP6Q7Z6E9 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RBBP6Q7Z6E9 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RBBP6Q7Z6E9 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RBBP6Q7Z6E9 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RBBP6Q7Z6E9 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RBBP6Q7Z6E9 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
RBBP6Q7Z6E9 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RBBP6Q7Z6E9 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RBBP6Q7Z6E9 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RBBP6Q7Z6E9 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RBBP6Q7Z6E9 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RBBP6Q7Z6E9 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RBBP6Q7Z6E9 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RBBP6Q7Z6E9 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
RBBP6Q7Z6E9 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RBBP6Q7Z6E9 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RBBP6Q7Z6E9 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RBBP6Q7Z6E9 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RBBP6Q7Z6E9 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
RBBP6Q7Z6E9 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RBBP6Q7Z6E9 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RBBP6Q7Z6E9 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RBBP6Q7Z6E9 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RBBP6Q7Z6E9 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RBBP6Q7Z6E9 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RBBP6Q7Z6E9 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RBBP6Q7Z6E9 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RBBP6Q7Z6E9 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RBBP6Q7Z6E9 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RBBP6Q7Z6E9 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RBBP6Q7Z6E9 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RBBP6Q7Z6E9 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RBBP6Q7Z6E9 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RBBP6Q7Z6E9 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RBBP6Q7Z6E9 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RBBP6Q7Z6E9 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RBBP6Q7Z6E9 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RBBP6Q7Z6E9 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RBBP6Q7Z6E9 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RBBP6Q7Z6E9 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
RBBP6Q7Z6E9 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
RBBP6Q7Z6E9 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
RBBP6Q7Z6E9 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
RBBP6Q7Z6E9 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RBBP6Q7Z6E9 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RBBP6Q7Z6E9 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RBBP6Q7Z6E9 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RBBP6Q7Z6E9 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RBBP6Q7Z6E9 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RBBP6Q7Z6E9 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RBBP6Q7Z6E9 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
RBBP6Q7Z6E9 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RBBP6Q7Z6E9 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RBBP6Q7Z6E9 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RBBP6Q7Z6E9 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms