Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3T8

ZFYVE16, Zinc finger FYVE domain-containing protein 16, humanhuman

Predictions only

Length 1,539 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFYVE16Q7Z3T8 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
ZFYVE16Q7Z3T8 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC34.28■■■■□ 3.08
ZFYVE16Q7Z3T8 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
ZFYVE16Q7Z3T8 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
ZFYVE16Q7Z3T8 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
ZFYVE16Q7Z3T8 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
ZFYVE16Q7Z3T8 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
ZFYVE16Q7Z3T8 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
ZFYVE16Q7Z3T8 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
ZFYVE16Q7Z3T8 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
ZFYVE16Q7Z3T8 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
ZFYVE16Q7Z3T8 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
ZFYVE16Q7Z3T8 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
ZFYVE16Q7Z3T8 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
ZFYVE16Q7Z3T8 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC34.26■■■■□ 3.08
ZFYVE16Q7Z3T8 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.08
ZFYVE16Q7Z3T8 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC34.26■■■■□ 3.08
ZFYVE16Q7Z3T8 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC34.26■■■■□ 3.08
ZFYVE16Q7Z3T8 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.08
ZFYVE16Q7Z3T8 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.08
ZFYVE16Q7Z3T8 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.07
ZFYVE16Q7Z3T8 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
ZFYVE16Q7Z3T8 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
ZFYVE16Q7Z3T8 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
ZFYVE16Q7Z3T8 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
ZFYVE16Q7Z3T8 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
ZFYVE16Q7Z3T8 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
ZFYVE16Q7Z3T8 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
ZFYVE16Q7Z3T8 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
ZFYVE16Q7Z3T8 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
ZFYVE16Q7Z3T8 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
ZFYVE16Q7Z3T8 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
ZFYVE16Q7Z3T8 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
ZFYVE16Q7Z3T8 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
ZFYVE16Q7Z3T8 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
ZFYVE16Q7Z3T8 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC34.23■■■■□ 3.07
ZFYVE16Q7Z3T8 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
ZFYVE16Q7Z3T8 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
ZFYVE16Q7Z3T8 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
ZFYVE16Q7Z3T8 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
ZFYVE16Q7Z3T8 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
ZFYVE16Q7Z3T8 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
ZFYVE16Q7Z3T8 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
ZFYVE16Q7Z3T8 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
ZFYVE16Q7Z3T8 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
ZFYVE16Q7Z3T8 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
ZFYVE16Q7Z3T8 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
ZFYVE16Q7Z3T8 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
ZFYVE16Q7Z3T8 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
ZFYVE16Q7Z3T8 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
ZFYVE16Q7Z3T8 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
ZFYVE16Q7Z3T8 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
ZFYVE16Q7Z3T8 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
ZFYVE16Q7Z3T8 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
ZFYVE16Q7Z3T8 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
ZFYVE16Q7Z3T8 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
ZFYVE16Q7Z3T8 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.06
ZFYVE16Q7Z3T8 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
ZFYVE16Q7Z3T8 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
ZFYVE16Q7Z3T8 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
ZFYVE16Q7Z3T8 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
ZFYVE16Q7Z3T8 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
ZFYVE16Q7Z3T8 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
ZFYVE16Q7Z3T8 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
ZFYVE16Q7Z3T8 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
ZFYVE16Q7Z3T8 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
ZFYVE16Q7Z3T8 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
ZFYVE16Q7Z3T8 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
ZFYVE16Q7Z3T8 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
ZFYVE16Q7Z3T8 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
ZFYVE16Q7Z3T8 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC34.17■■■■□ 3.06
ZFYVE16Q7Z3T8 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
ZFYVE16Q7Z3T8 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
ZFYVE16Q7Z3T8 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
ZFYVE16Q7Z3T8 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
ZFYVE16Q7Z3T8 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
ZFYVE16Q7Z3T8 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
ZFYVE16Q7Z3T8 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
ZFYVE16Q7Z3T8 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
ZFYVE16Q7Z3T8 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
ZFYVE16Q7Z3T8 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
ZFYVE16Q7Z3T8 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
ZFYVE16Q7Z3T8 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
ZFYVE16Q7Z3T8 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC34.15■■■■□ 3.06
ZFYVE16Q7Z3T8 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
ZFYVE16Q7Z3T8 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
ZFYVE16Q7Z3T8 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
ZFYVE16Q7Z3T8 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
ZFYVE16Q7Z3T8 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
ZFYVE16Q7Z3T8 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
ZFYVE16Q7Z3T8 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
ZFYVE16Q7Z3T8 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
ZFYVE16Q7Z3T8 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
ZFYVE16Q7Z3T8 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC34.14■■■■□ 3.06
ZFYVE16Q7Z3T8 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
ZFYVE16Q7Z3T8 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
ZFYVE16Q7Z3T8 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
ZFYVE16Q7Z3T8 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC34.14■■■■□ 3.06
ZFYVE16Q7Z3T8 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
ZFYVE16Q7Z3T8 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms