Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3J3

RGPD4, RanBP2-like and GRIP domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD4Q7Z3J3 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
RGPD4Q7Z3J3 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
RGPD4Q7Z3J3 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
RGPD4Q7Z3J3 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
RGPD4Q7Z3J3 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
RGPD4Q7Z3J3 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
RGPD4Q7Z3J3 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
RGPD4Q7Z3J3 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
RGPD4Q7Z3J3 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
RGPD4Q7Z3J3 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
RGPD4Q7Z3J3 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
RGPD4Q7Z3J3 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
RGPD4Q7Z3J3 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
RGPD4Q7Z3J3 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
RGPD4Q7Z3J3 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
RGPD4Q7Z3J3 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
RGPD4Q7Z3J3 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
RGPD4Q7Z3J3 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
RGPD4Q7Z3J3 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
RGPD4Q7Z3J3 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
RGPD4Q7Z3J3 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC29.15■■■□□ 2.26
RGPD4Q7Z3J3 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
RGPD4Q7Z3J3 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
RGPD4Q7Z3J3 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
RGPD4Q7Z3J3 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
RGPD4Q7Z3J3 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
RGPD4Q7Z3J3 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
RGPD4Q7Z3J3 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
RGPD4Q7Z3J3 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
RGPD4Q7Z3J3 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
RGPD4Q7Z3J3 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
RGPD4Q7Z3J3 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
RGPD4Q7Z3J3 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
RGPD4Q7Z3J3 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
RGPD4Q7Z3J3 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC29.13■■■□□ 2.25
RGPD4Q7Z3J3 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
RGPD4Q7Z3J3 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
RGPD4Q7Z3J3 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
RGPD4Q7Z3J3 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
RGPD4Q7Z3J3 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
RGPD4Q7Z3J3 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
RGPD4Q7Z3J3 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
RGPD4Q7Z3J3 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
RGPD4Q7Z3J3 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
RGPD4Q7Z3J3 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
RGPD4Q7Z3J3 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
RGPD4Q7Z3J3 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
RGPD4Q7Z3J3 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
RGPD4Q7Z3J3 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
RGPD4Q7Z3J3 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
RGPD4Q7Z3J3 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
RGPD4Q7Z3J3 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
RGPD4Q7Z3J3 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
RGPD4Q7Z3J3 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
RGPD4Q7Z3J3 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
RGPD4Q7Z3J3 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
RGPD4Q7Z3J3 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
RGPD4Q7Z3J3 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
RGPD4Q7Z3J3 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
RGPD4Q7Z3J3 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
RGPD4Q7Z3J3 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
RGPD4Q7Z3J3 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
RGPD4Q7Z3J3 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
RGPD4Q7Z3J3 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
RGPD4Q7Z3J3 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
RGPD4Q7Z3J3 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
RGPD4Q7Z3J3 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
RGPD4Q7Z3J3 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RGPD4Q7Z3J3 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
RGPD4Q7Z3J3 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RGPD4Q7Z3J3 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RGPD4Q7Z3J3 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RGPD4Q7Z3J3 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
RGPD4Q7Z3J3 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
RGPD4Q7Z3J3 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RGPD4Q7Z3J3 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RGPD4Q7Z3J3 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RGPD4Q7Z3J3 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
RGPD4Q7Z3J3 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
RGPD4Q7Z3J3 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RGPD4Q7Z3J3 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RGPD4Q7Z3J3 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
RGPD4Q7Z3J3 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
RGPD4Q7Z3J3 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
RGPD4Q7Z3J3 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
RGPD4Q7Z3J3 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
RGPD4Q7Z3J3 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
RGPD4Q7Z3J3 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
RGPD4Q7Z3J3 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
RGPD4Q7Z3J3 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
RGPD4Q7Z3J3 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
RGPD4Q7Z3J3 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
RGPD4Q7Z3J3 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
RGPD4Q7Z3J3 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
RGPD4Q7Z3J3 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
RGPD4Q7Z3J3 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC29.06■■■□□ 2.24
RGPD4Q7Z3J3 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
RGPD4Q7Z3J3 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
RGPD4Q7Z3J3 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
RGPD4Q7Z3J3 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms