Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z2E3

APTX, Aprataxin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APTXQ7Z2E3 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
APTXQ7Z2E3 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
APTXQ7Z2E3 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
APTXQ7Z2E3 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
APTXQ7Z2E3 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
APTXQ7Z2E3 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
APTXQ7Z2E3 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
APTXQ7Z2E3 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
APTXQ7Z2E3 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
APTXQ7Z2E3 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
APTXQ7Z2E3 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
APTXQ7Z2E3 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
APTXQ7Z2E3 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
APTXQ7Z2E3 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
APTXQ7Z2E3 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
APTXQ7Z2E3 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
APTXQ7Z2E3 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
APTXQ7Z2E3 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
APTXQ7Z2E3 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
APTXQ7Z2E3 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
APTXQ7Z2E3 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
APTXQ7Z2E3 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
APTXQ7Z2E3 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
APTXQ7Z2E3 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
APTXQ7Z2E3 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
APTXQ7Z2E3 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
APTXQ7Z2E3 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
APTXQ7Z2E3 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
APTXQ7Z2E3 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
APTXQ7Z2E3 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
APTXQ7Z2E3 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
APTXQ7Z2E3 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
APTXQ7Z2E3 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
APTXQ7Z2E3 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
APTXQ7Z2E3 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
APTXQ7Z2E3 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
APTXQ7Z2E3 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
APTXQ7Z2E3 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
APTXQ7Z2E3 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
APTXQ7Z2E3 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
APTXQ7Z2E3 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
APTXQ7Z2E3 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
APTXQ7Z2E3 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
APTXQ7Z2E3 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
APTXQ7Z2E3 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
APTXQ7Z2E3 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
APTXQ7Z2E3 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
APTXQ7Z2E3 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
APTXQ7Z2E3 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
APTXQ7Z2E3 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
APTXQ7Z2E3 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
APTXQ7Z2E3 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
APTXQ7Z2E3 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
APTXQ7Z2E3 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
APTXQ7Z2E3 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
APTXQ7Z2E3 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
APTXQ7Z2E3 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
APTXQ7Z2E3 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
APTXQ7Z2E3 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
APTXQ7Z2E3 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
APTXQ7Z2E3 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
APTXQ7Z2E3 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
APTXQ7Z2E3 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
APTXQ7Z2E3 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
APTXQ7Z2E3 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
APTXQ7Z2E3 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
APTXQ7Z2E3 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
APTXQ7Z2E3 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
APTXQ7Z2E3 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
APTXQ7Z2E3 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
APTXQ7Z2E3 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
APTXQ7Z2E3 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
APTXQ7Z2E3 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
APTXQ7Z2E3 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
APTXQ7Z2E3 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
APTXQ7Z2E3 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
APTXQ7Z2E3 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
APTXQ7Z2E3 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
APTXQ7Z2E3 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
APTXQ7Z2E3 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
APTXQ7Z2E3 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
APTXQ7Z2E3 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
APTXQ7Z2E3 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
APTXQ7Z2E3 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
APTXQ7Z2E3 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
APTXQ7Z2E3 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
APTXQ7Z2E3 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
APTXQ7Z2E3 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
APTXQ7Z2E3 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
APTXQ7Z2E3 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
APTXQ7Z2E3 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
APTXQ7Z2E3 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
APTXQ7Z2E3 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
APTXQ7Z2E3 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
APTXQ7Z2E3 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
APTXQ7Z2E3 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
APTXQ7Z2E3 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
APTXQ7Z2E3 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
APTXQ7Z2E3 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
APTXQ7Z2E3 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms