Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS6

OTOP2, Otopetrin-2, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOP2Q7RTS6 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
OTOP2Q7RTS6 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
OTOP2Q7RTS6 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
OTOP2Q7RTS6 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
OTOP2Q7RTS6 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
OTOP2Q7RTS6 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
OTOP2Q7RTS6 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
OTOP2Q7RTS6 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
OTOP2Q7RTS6 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
OTOP2Q7RTS6 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
OTOP2Q7RTS6 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
OTOP2Q7RTS6 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
OTOP2Q7RTS6 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
OTOP2Q7RTS6 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
OTOP2Q7RTS6 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
OTOP2Q7RTS6 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
OTOP2Q7RTS6 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
OTOP2Q7RTS6 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
OTOP2Q7RTS6 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
OTOP2Q7RTS6 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
OTOP2Q7RTS6 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
OTOP2Q7RTS6 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
OTOP2Q7RTS6 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
OTOP2Q7RTS6 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
OTOP2Q7RTS6 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
OTOP2Q7RTS6 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
OTOP2Q7RTS6 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
OTOP2Q7RTS6 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
OTOP2Q7RTS6 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
OTOP2Q7RTS6 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
OTOP2Q7RTS6 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
OTOP2Q7RTS6 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
OTOP2Q7RTS6 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
OTOP2Q7RTS6 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
OTOP2Q7RTS6 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
OTOP2Q7RTS6 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
OTOP2Q7RTS6 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
OTOP2Q7RTS6 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
OTOP2Q7RTS6 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
OTOP2Q7RTS6 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
OTOP2Q7RTS6 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
OTOP2Q7RTS6 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
OTOP2Q7RTS6 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
OTOP2Q7RTS6 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
OTOP2Q7RTS6 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
OTOP2Q7RTS6 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
OTOP2Q7RTS6 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
OTOP2Q7RTS6 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
OTOP2Q7RTS6 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
OTOP2Q7RTS6 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
OTOP2Q7RTS6 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
OTOP2Q7RTS6 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
OTOP2Q7RTS6 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
OTOP2Q7RTS6 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
OTOP2Q7RTS6 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
OTOP2Q7RTS6 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
OTOP2Q7RTS6 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
OTOP2Q7RTS6 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
OTOP2Q7RTS6 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
OTOP2Q7RTS6 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
OTOP2Q7RTS6 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
OTOP2Q7RTS6 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
OTOP2Q7RTS6 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
OTOP2Q7RTS6 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
OTOP2Q7RTS6 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
OTOP2Q7RTS6 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
OTOP2Q7RTS6 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
OTOP2Q7RTS6 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
OTOP2Q7RTS6 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
OTOP2Q7RTS6 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
OTOP2Q7RTS6 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
OTOP2Q7RTS6 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
OTOP2Q7RTS6 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
OTOP2Q7RTS6 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
OTOP2Q7RTS6 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
OTOP2Q7RTS6 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
OTOP2Q7RTS6 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
OTOP2Q7RTS6 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
OTOP2Q7RTS6 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
OTOP2Q7RTS6 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
OTOP2Q7RTS6 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
OTOP2Q7RTS6 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
OTOP2Q7RTS6 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
OTOP2Q7RTS6 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
OTOP2Q7RTS6 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
OTOP2Q7RTS6 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
OTOP2Q7RTS6 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
OTOP2Q7RTS6 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
OTOP2Q7RTS6 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
OTOP2Q7RTS6 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
OTOP2Q7RTS6 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
OTOP2Q7RTS6 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
OTOP2Q7RTS6 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
OTOP2Q7RTS6 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
OTOP2Q7RTS6 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
OTOP2Q7RTS6 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
OTOP2Q7RTS6 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
OTOP2Q7RTS6 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
OTOP2Q7RTS6 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
OTOP2Q7RTS6 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms