Protein–RNA interactions for Protein: Q7LGA3

HS2ST1, Heparan sulfate 2-O-sulfotransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HS2ST1Q7LGA3 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HS2ST1Q7LGA3 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HS2ST1Q7LGA3 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HS2ST1Q7LGA3 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HS2ST1Q7LGA3 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HS2ST1Q7LGA3 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HS2ST1Q7LGA3 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HS2ST1Q7LGA3 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HS2ST1Q7LGA3 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HS2ST1Q7LGA3 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HS2ST1Q7LGA3 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HS2ST1Q7LGA3 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
HS2ST1Q7LGA3 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HS2ST1Q7LGA3 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HS2ST1Q7LGA3 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HS2ST1Q7LGA3 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HS2ST1Q7LGA3 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
HS2ST1Q7LGA3 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HS2ST1Q7LGA3 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HS2ST1Q7LGA3 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HS2ST1Q7LGA3 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HS2ST1Q7LGA3 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HS2ST1Q7LGA3 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HS2ST1Q7LGA3 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HS2ST1Q7LGA3 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HS2ST1Q7LGA3 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HS2ST1Q7LGA3 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HS2ST1Q7LGA3 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HS2ST1Q7LGA3 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HS2ST1Q7LGA3 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HS2ST1Q7LGA3 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
HS2ST1Q7LGA3 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HS2ST1Q7LGA3 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HS2ST1Q7LGA3 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HS2ST1Q7LGA3 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HS2ST1Q7LGA3 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HS2ST1Q7LGA3 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HS2ST1Q7LGA3 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HS2ST1Q7LGA3 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HS2ST1Q7LGA3 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HS2ST1Q7LGA3 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HS2ST1Q7LGA3 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HS2ST1Q7LGA3 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HS2ST1Q7LGA3 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HS2ST1Q7LGA3 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HS2ST1Q7LGA3 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HS2ST1Q7LGA3 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HS2ST1Q7LGA3 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HS2ST1Q7LGA3 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HS2ST1Q7LGA3 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HS2ST1Q7LGA3 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HS2ST1Q7LGA3 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HS2ST1Q7LGA3 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HS2ST1Q7LGA3 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HS2ST1Q7LGA3 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HS2ST1Q7LGA3 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HS2ST1Q7LGA3 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
HS2ST1Q7LGA3 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HS2ST1Q7LGA3 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HS2ST1Q7LGA3 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HS2ST1Q7LGA3 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HS2ST1Q7LGA3 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HS2ST1Q7LGA3 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HS2ST1Q7LGA3 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HS2ST1Q7LGA3 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HS2ST1Q7LGA3 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HS2ST1Q7LGA3 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HS2ST1Q7LGA3 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HS2ST1Q7LGA3 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
HS2ST1Q7LGA3 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HS2ST1Q7LGA3 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HS2ST1Q7LGA3 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HS2ST1Q7LGA3 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HS2ST1Q7LGA3 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HS2ST1Q7LGA3 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HS2ST1Q7LGA3 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HS2ST1Q7LGA3 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HS2ST1Q7LGA3 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
HS2ST1Q7LGA3 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
HS2ST1Q7LGA3 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
HS2ST1Q7LGA3 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HS2ST1Q7LGA3 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HS2ST1Q7LGA3 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HS2ST1Q7LGA3 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HS2ST1Q7LGA3 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HS2ST1Q7LGA3 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HS2ST1Q7LGA3 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HS2ST1Q7LGA3 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HS2ST1Q7LGA3 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HS2ST1Q7LGA3 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HS2ST1Q7LGA3 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
HS2ST1Q7LGA3 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HS2ST1Q7LGA3 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HS2ST1Q7LGA3 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HS2ST1Q7LGA3 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HS2ST1Q7LGA3 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HS2ST1Q7LGA3 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HS2ST1Q7LGA3 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HS2ST1Q7LGA3 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HS2ST1Q7LGA3 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms