Protein–RNA interactions for Protein: Q71RC9

SMIM5, Small integral membrane protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM5Q71RC9 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SMIM5Q71RC9 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SMIM5Q71RC9 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SMIM5Q71RC9 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SMIM5Q71RC9 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SMIM5Q71RC9 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SMIM5Q71RC9 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SMIM5Q71RC9 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SMIM5Q71RC9 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SMIM5Q71RC9 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SMIM5Q71RC9 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SMIM5Q71RC9 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SMIM5Q71RC9 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SMIM5Q71RC9 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SMIM5Q71RC9 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SMIM5Q71RC9 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SMIM5Q71RC9 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SMIM5Q71RC9 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SMIM5Q71RC9 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SMIM5Q71RC9 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SMIM5Q71RC9 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SMIM5Q71RC9 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SMIM5Q71RC9 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SMIM5Q71RC9 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SMIM5Q71RC9 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
SMIM5Q71RC9 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SMIM5Q71RC9 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SMIM5Q71RC9 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SMIM5Q71RC9 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
SMIM5Q71RC9 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
SMIM5Q71RC9 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SMIM5Q71RC9 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SMIM5Q71RC9 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SMIM5Q71RC9 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SMIM5Q71RC9 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SMIM5Q71RC9 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SMIM5Q71RC9 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SMIM5Q71RC9 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SMIM5Q71RC9 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SMIM5Q71RC9 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SMIM5Q71RC9 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SMIM5Q71RC9 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SMIM5Q71RC9 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SMIM5Q71RC9 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
SMIM5Q71RC9 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SMIM5Q71RC9 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SMIM5Q71RC9 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.2
SMIM5Q71RC9 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SMIM5Q71RC9 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
SMIM5Q71RC9 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SMIM5Q71RC9 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SMIM5Q71RC9 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SMIM5Q71RC9 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SMIM5Q71RC9 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
SMIM5Q71RC9 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SMIM5Q71RC9 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SMIM5Q71RC9 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SMIM5Q71RC9 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SMIM5Q71RC9 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SMIM5Q71RC9 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SMIM5Q71RC9 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SMIM5Q71RC9 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
SMIM5Q71RC9 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SMIM5Q71RC9 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SMIM5Q71RC9 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
SMIM5Q71RC9 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SMIM5Q71RC9 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SMIM5Q71RC9 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SMIM5Q71RC9 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
SMIM5Q71RC9 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
SMIM5Q71RC9 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
SMIM5Q71RC9 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SMIM5Q71RC9 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SMIM5Q71RC9 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SMIM5Q71RC9 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SMIM5Q71RC9 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SMIM5Q71RC9 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SMIM5Q71RC9 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SMIM5Q71RC9 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SMIM5Q71RC9 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SMIM5Q71RC9 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
SMIM5Q71RC9 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SMIM5Q71RC9 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SMIM5Q71RC9 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SMIM5Q71RC9 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SMIM5Q71RC9 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SMIM5Q71RC9 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SMIM5Q71RC9 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SMIM5Q71RC9 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SMIM5Q71RC9 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SMIM5Q71RC9 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
SMIM5Q71RC9 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SMIM5Q71RC9 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
SMIM5Q71RC9 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SMIM5Q71RC9 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
SMIM5Q71RC9 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SMIM5Q71RC9 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SMIM5Q71RC9 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SMIM5Q71RC9 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SMIM5Q71RC9 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms