Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL3

USP50, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 50, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP50Q70EL3 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
USP50Q70EL3 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
USP50Q70EL3 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
USP50Q70EL3 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
USP50Q70EL3 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
USP50Q70EL3 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
USP50Q70EL3 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
USP50Q70EL3 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
USP50Q70EL3 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
USP50Q70EL3 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
USP50Q70EL3 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
USP50Q70EL3 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
USP50Q70EL3 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
USP50Q70EL3 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
USP50Q70EL3 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
USP50Q70EL3 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
USP50Q70EL3 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
USP50Q70EL3 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
USP50Q70EL3 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
USP50Q70EL3 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
USP50Q70EL3 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
USP50Q70EL3 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
USP50Q70EL3 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
USP50Q70EL3 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
USP50Q70EL3 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
USP50Q70EL3 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
USP50Q70EL3 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
USP50Q70EL3 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
USP50Q70EL3 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
USP50Q70EL3 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
USP50Q70EL3 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
USP50Q70EL3 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
USP50Q70EL3 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
USP50Q70EL3 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
USP50Q70EL3 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
USP50Q70EL3 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
USP50Q70EL3 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
USP50Q70EL3 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
USP50Q70EL3 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
USP50Q70EL3 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
USP50Q70EL3 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
USP50Q70EL3 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
USP50Q70EL3 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
USP50Q70EL3 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
USP50Q70EL3 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
USP50Q70EL3 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
USP50Q70EL3 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
USP50Q70EL3 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
USP50Q70EL3 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
USP50Q70EL3 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
USP50Q70EL3 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
USP50Q70EL3 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
USP50Q70EL3 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
USP50Q70EL3 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
USP50Q70EL3 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
USP50Q70EL3 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
USP50Q70EL3 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
USP50Q70EL3 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC26.97■■□□□ 1.91
USP50Q70EL3 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC26.97■■□□□ 1.91
USP50Q70EL3 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
USP50Q70EL3 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
USP50Q70EL3 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
USP50Q70EL3 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
USP50Q70EL3 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
USP50Q70EL3 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
USP50Q70EL3 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
USP50Q70EL3 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
USP50Q70EL3 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
USP50Q70EL3 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
USP50Q70EL3 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
USP50Q70EL3 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
USP50Q70EL3 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
USP50Q70EL3 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
USP50Q70EL3 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
USP50Q70EL3 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
USP50Q70EL3 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
USP50Q70EL3 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
USP50Q70EL3 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
USP50Q70EL3 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
USP50Q70EL3 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
USP50Q70EL3 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
USP50Q70EL3 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
USP50Q70EL3 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
USP50Q70EL3 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
USP50Q70EL3 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
USP50Q70EL3 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
USP50Q70EL3 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
USP50Q70EL3 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC26.95■■□□□ 1.9
USP50Q70EL3 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
USP50Q70EL3 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
USP50Q70EL3 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
USP50Q70EL3 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
USP50Q70EL3 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
USP50Q70EL3 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
USP50Q70EL3 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
USP50Q70EL3 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
USP50Q70EL3 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC26.94■■□□□ 1.9
USP50Q70EL3 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
USP50Q70EL3 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
USP50Q70EL3 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
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