Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX27

VSTM1, V-set and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM1Q6UX27 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VSTM1Q6UX27 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VSTM1Q6UX27 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VSTM1Q6UX27 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VSTM1Q6UX27 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
VSTM1Q6UX27 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
VSTM1Q6UX27 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
VSTM1Q6UX27 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
VSTM1Q6UX27 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
VSTM1Q6UX27 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
VSTM1Q6UX27 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
VSTM1Q6UX27 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
VSTM1Q6UX27 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
VSTM1Q6UX27 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
VSTM1Q6UX27 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
VSTM1Q6UX27 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
VSTM1Q6UX27 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
VSTM1Q6UX27 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
VSTM1Q6UX27 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VSTM1Q6UX27 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
VSTM1Q6UX27 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VSTM1Q6UX27 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VSTM1Q6UX27 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
VSTM1Q6UX27 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VSTM1Q6UX27 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
VSTM1Q6UX27 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
VSTM1Q6UX27 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VSTM1Q6UX27 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
VSTM1Q6UX27 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
VSTM1Q6UX27 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
VSTM1Q6UX27 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
VSTM1Q6UX27 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
VSTM1Q6UX27 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
VSTM1Q6UX27 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
VSTM1Q6UX27 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
VSTM1Q6UX27 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
VSTM1Q6UX27 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
VSTM1Q6UX27 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
VSTM1Q6UX27 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
VSTM1Q6UX27 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
VSTM1Q6UX27 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
VSTM1Q6UX27 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
VSTM1Q6UX27 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
VSTM1Q6UX27 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
VSTM1Q6UX27 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
VSTM1Q6UX27 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
VSTM1Q6UX27 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
VSTM1Q6UX27 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
VSTM1Q6UX27 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
VSTM1Q6UX27 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
VSTM1Q6UX27 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
VSTM1Q6UX27 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
VSTM1Q6UX27 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
VSTM1Q6UX27 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
VSTM1Q6UX27 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
VSTM1Q6UX27 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
VSTM1Q6UX27 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
VSTM1Q6UX27 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
VSTM1Q6UX27 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
VSTM1Q6UX27 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
VSTM1Q6UX27 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
VSTM1Q6UX27 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
VSTM1Q6UX27 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
VSTM1Q6UX27 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
VSTM1Q6UX27 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
VSTM1Q6UX27 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
VSTM1Q6UX27 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
VSTM1Q6UX27 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
VSTM1Q6UX27 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
VSTM1Q6UX27 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
VSTM1Q6UX27 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
VSTM1Q6UX27 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
VSTM1Q6UX27 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
VSTM1Q6UX27 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
VSTM1Q6UX27 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
VSTM1Q6UX27 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
VSTM1Q6UX27 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
VSTM1Q6UX27 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
VSTM1Q6UX27 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
VSTM1Q6UX27 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
VSTM1Q6UX27 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
VSTM1Q6UX27 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
VSTM1Q6UX27 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
VSTM1Q6UX27 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
VSTM1Q6UX27 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
VSTM1Q6UX27 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
VSTM1Q6UX27 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
VSTM1Q6UX27 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
VSTM1Q6UX27 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
VSTM1Q6UX27 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
VSTM1Q6UX27 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
VSTM1Q6UX27 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
VSTM1Q6UX27 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
VSTM1Q6UX27 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
VSTM1Q6UX27 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
VSTM1Q6UX27 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
VSTM1Q6UX27 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
VSTM1Q6UX27 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
VSTM1Q6UX27 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
VSTM1Q6UX27 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms