Protein–RNA interactions for Protein: Q6SZW1

SARM1, Sterile alpha and TIR motif-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SARM1Q6SZW1 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SARM1Q6SZW1 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SARM1Q6SZW1 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SARM1Q6SZW1 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SARM1Q6SZW1 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SARM1Q6SZW1 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SARM1Q6SZW1 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SARM1Q6SZW1 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SARM1Q6SZW1 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SARM1Q6SZW1 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SARM1Q6SZW1 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SARM1Q6SZW1 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SARM1Q6SZW1 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SARM1Q6SZW1 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SARM1Q6SZW1 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SARM1Q6SZW1 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SARM1Q6SZW1 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SARM1Q6SZW1 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SARM1Q6SZW1 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SARM1Q6SZW1 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SARM1Q6SZW1 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SARM1Q6SZW1 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SARM1Q6SZW1 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SARM1Q6SZW1 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SARM1Q6SZW1 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SARM1Q6SZW1 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SARM1Q6SZW1 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SARM1Q6SZW1 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SARM1Q6SZW1 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SARM1Q6SZW1 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SARM1Q6SZW1 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SARM1Q6SZW1 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SARM1Q6SZW1 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SARM1Q6SZW1 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SARM1Q6SZW1 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SARM1Q6SZW1 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SARM1Q6SZW1 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SARM1Q6SZW1 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SARM1Q6SZW1 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SARM1Q6SZW1 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SARM1Q6SZW1 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SARM1Q6SZW1 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SARM1Q6SZW1 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SARM1Q6SZW1 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SARM1Q6SZW1 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SARM1Q6SZW1 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SARM1Q6SZW1 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SARM1Q6SZW1 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SARM1Q6SZW1 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SARM1Q6SZW1 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SARM1Q6SZW1 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SARM1Q6SZW1 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SARM1Q6SZW1 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SARM1Q6SZW1 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SARM1Q6SZW1 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SARM1Q6SZW1 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SARM1Q6SZW1 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SARM1Q6SZW1 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SARM1Q6SZW1 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SARM1Q6SZW1 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SARM1Q6SZW1 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SARM1Q6SZW1 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SARM1Q6SZW1 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SARM1Q6SZW1 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SARM1Q6SZW1 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SARM1Q6SZW1 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SARM1Q6SZW1 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SARM1Q6SZW1 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SARM1Q6SZW1 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SARM1Q6SZW1 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SARM1Q6SZW1 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SARM1Q6SZW1 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SARM1Q6SZW1 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SARM1Q6SZW1 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SARM1Q6SZW1 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SARM1Q6SZW1 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SARM1Q6SZW1 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SARM1Q6SZW1 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SARM1Q6SZW1 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SARM1Q6SZW1 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SARM1Q6SZW1 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SARM1Q6SZW1 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SARM1Q6SZW1 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SARM1Q6SZW1 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SARM1Q6SZW1 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SARM1Q6SZW1 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SARM1Q6SZW1 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SARM1Q6SZW1 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SARM1Q6SZW1 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SARM1Q6SZW1 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SARM1Q6SZW1 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SARM1Q6SZW1 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SARM1Q6SZW1 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SARM1Q6SZW1 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SARM1Q6SZW1 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SARM1Q6SZW1 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SARM1Q6SZW1 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SARM1Q6SZW1 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SARM1Q6SZW1 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SARM1Q6SZW1 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105 ms