Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIU1

KCNV1, Potassium voltage-gated channel subfamily V member 1, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNV1Q6PIU1 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KCNV1Q6PIU1 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
KCNV1Q6PIU1 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KCNV1Q6PIU1 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KCNV1Q6PIU1 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KCNV1Q6PIU1 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KCNV1Q6PIU1 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KCNV1Q6PIU1 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KCNV1Q6PIU1 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KCNV1Q6PIU1 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KCNV1Q6PIU1 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KCNV1Q6PIU1 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KCNV1Q6PIU1 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KCNV1Q6PIU1 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KCNV1Q6PIU1 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KCNV1Q6PIU1 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KCNV1Q6PIU1 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KCNV1Q6PIU1 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KCNV1Q6PIU1 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KCNV1Q6PIU1 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KCNV1Q6PIU1 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KCNV1Q6PIU1 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KCNV1Q6PIU1 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KCNV1Q6PIU1 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KCNV1Q6PIU1 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KCNV1Q6PIU1 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
KCNV1Q6PIU1 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KCNV1Q6PIU1 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KCNV1Q6PIU1 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KCNV1Q6PIU1 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KCNV1Q6PIU1 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KCNV1Q6PIU1 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KCNV1Q6PIU1 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
KCNV1Q6PIU1 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KCNV1Q6PIU1 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
KCNV1Q6PIU1 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
KCNV1Q6PIU1 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
KCNV1Q6PIU1 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
KCNV1Q6PIU1 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KCNV1Q6PIU1 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
KCNV1Q6PIU1 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KCNV1Q6PIU1 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KCNV1Q6PIU1 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KCNV1Q6PIU1 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KCNV1Q6PIU1 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KCNV1Q6PIU1 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KCNV1Q6PIU1 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
KCNV1Q6PIU1 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KCNV1Q6PIU1 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KCNV1Q6PIU1 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KCNV1Q6PIU1 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KCNV1Q6PIU1 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
KCNV1Q6PIU1 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KCNV1Q6PIU1 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KCNV1Q6PIU1 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KCNV1Q6PIU1 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KCNV1Q6PIU1 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KCNV1Q6PIU1 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KCNV1Q6PIU1 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KCNV1Q6PIU1 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
KCNV1Q6PIU1 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KCNV1Q6PIU1 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KCNV1Q6PIU1 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KCNV1Q6PIU1 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KCNV1Q6PIU1 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KCNV1Q6PIU1 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KCNV1Q6PIU1 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KCNV1Q6PIU1 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
KCNV1Q6PIU1 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
KCNV1Q6PIU1 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
KCNV1Q6PIU1 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
KCNV1Q6PIU1 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
KCNV1Q6PIU1 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
KCNV1Q6PIU1 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
KCNV1Q6PIU1 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
KCNV1Q6PIU1 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
KCNV1Q6PIU1 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
KCNV1Q6PIU1 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
KCNV1Q6PIU1 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KCNV1Q6PIU1 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
KCNV1Q6PIU1 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
KCNV1Q6PIU1 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KCNV1Q6PIU1 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KCNV1Q6PIU1 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KCNV1Q6PIU1 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KCNV1Q6PIU1 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KCNV1Q6PIU1 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KCNV1Q6PIU1 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KCNV1Q6PIU1 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KCNV1Q6PIU1 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KCNV1Q6PIU1 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KCNV1Q6PIU1 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KCNV1Q6PIU1 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KCNV1Q6PIU1 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KCNV1Q6PIU1 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KCNV1Q6PIU1 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KCNV1Q6PIU1 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KCNV1Q6PIU1 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KCNV1Q6PIU1 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KCNV1Q6PIU1 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms