Protein–RNA interactions for Protein: Q6L8Q7

PDE12, 2',5'-phosphodiesterase 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 609 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE12Q6L8Q7 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDE12Q6L8Q7 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDE12Q6L8Q7 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDE12Q6L8Q7 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDE12Q6L8Q7 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDE12Q6L8Q7 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDE12Q6L8Q7 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDE12Q6L8Q7 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDE12Q6L8Q7 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDE12Q6L8Q7 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDE12Q6L8Q7 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDE12Q6L8Q7 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDE12Q6L8Q7 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDE12Q6L8Q7 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDE12Q6L8Q7 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDE12Q6L8Q7 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDE12Q6L8Q7 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDE12Q6L8Q7 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDE12Q6L8Q7 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDE12Q6L8Q7 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDE12Q6L8Q7 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDE12Q6L8Q7 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDE12Q6L8Q7 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PDE12Q6L8Q7 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDE12Q6L8Q7 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDE12Q6L8Q7 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDE12Q6L8Q7 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDE12Q6L8Q7 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDE12Q6L8Q7 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDE12Q6L8Q7 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDE12Q6L8Q7 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDE12Q6L8Q7 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDE12Q6L8Q7 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDE12Q6L8Q7 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDE12Q6L8Q7 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDE12Q6L8Q7 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDE12Q6L8Q7 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDE12Q6L8Q7 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDE12Q6L8Q7 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PDE12Q6L8Q7 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PDE12Q6L8Q7 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDE12Q6L8Q7 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDE12Q6L8Q7 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDE12Q6L8Q7 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PDE12Q6L8Q7 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PDE12Q6L8Q7 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PDE12Q6L8Q7 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PDE12Q6L8Q7 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PDE12Q6L8Q7 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PDE12Q6L8Q7 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
PDE12Q6L8Q7 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
PDE12Q6L8Q7 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PDE12Q6L8Q7 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PDE12Q6L8Q7 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PDE12Q6L8Q7 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
PDE12Q6L8Q7 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDE12Q6L8Q7 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDE12Q6L8Q7 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDE12Q6L8Q7 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDE12Q6L8Q7 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PDE12Q6L8Q7 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDE12Q6L8Q7 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PDE12Q6L8Q7 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDE12Q6L8Q7 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDE12Q6L8Q7 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PDE12Q6L8Q7 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDE12Q6L8Q7 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDE12Q6L8Q7 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDE12Q6L8Q7 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDE12Q6L8Q7 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDE12Q6L8Q7 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDE12Q6L8Q7 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDE12Q6L8Q7 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDE12Q6L8Q7 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDE12Q6L8Q7 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PDE12Q6L8Q7 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PDE12Q6L8Q7 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PDE12Q6L8Q7 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDE12Q6L8Q7 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PDE12Q6L8Q7 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDE12Q6L8Q7 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDE12Q6L8Q7 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDE12Q6L8Q7 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDE12Q6L8Q7 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDE12Q6L8Q7 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDE12Q6L8Q7 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
PDE12Q6L8Q7 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDE12Q6L8Q7 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDE12Q6L8Q7 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDE12Q6L8Q7 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDE12Q6L8Q7 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDE12Q6L8Q7 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDE12Q6L8Q7 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDE12Q6L8Q7 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDE12Q6L8Q7 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PDE12Q6L8Q7 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PDE12Q6L8Q7 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PDE12Q6L8Q7 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
PDE12Q6L8Q7 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PDE12Q6L8Q7 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms