Protein–RNA interactions for Protein: Q6IMN6

CAPRIN2, Caprin-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPRIN2Q6IMN6 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CAPRIN2Q6IMN6 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CAPRIN2Q6IMN6 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CAPRIN2Q6IMN6 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CAPRIN2Q6IMN6 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CAPRIN2Q6IMN6 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CAPRIN2Q6IMN6 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CAPRIN2Q6IMN6 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CAPRIN2Q6IMN6 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CAPRIN2Q6IMN6 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CAPRIN2Q6IMN6 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CAPRIN2Q6IMN6 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CAPRIN2Q6IMN6 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CAPRIN2Q6IMN6 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CAPRIN2Q6IMN6 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CAPRIN2Q6IMN6 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CAPRIN2Q6IMN6 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CAPRIN2Q6IMN6 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CAPRIN2Q6IMN6 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CAPRIN2Q6IMN6 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CAPRIN2Q6IMN6 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CAPRIN2Q6IMN6 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CAPRIN2Q6IMN6 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CAPRIN2Q6IMN6 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CAPRIN2Q6IMN6 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CAPRIN2Q6IMN6 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CAPRIN2Q6IMN6 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CAPRIN2Q6IMN6 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAPRIN2Q6IMN6 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAPRIN2Q6IMN6 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAPRIN2Q6IMN6 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAPRIN2Q6IMN6 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAPRIN2Q6IMN6 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAPRIN2Q6IMN6 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAPRIN2Q6IMN6 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAPRIN2Q6IMN6 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAPRIN2Q6IMN6 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAPRIN2Q6IMN6 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAPRIN2Q6IMN6 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAPRIN2Q6IMN6 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAPRIN2Q6IMN6 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAPRIN2Q6IMN6 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAPRIN2Q6IMN6 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAPRIN2Q6IMN6 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAPRIN2Q6IMN6 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAPRIN2Q6IMN6 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAPRIN2Q6IMN6 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAPRIN2Q6IMN6 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAPRIN2Q6IMN6 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAPRIN2Q6IMN6 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAPRIN2Q6IMN6 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAPRIN2Q6IMN6 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAPRIN2Q6IMN6 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAPRIN2Q6IMN6 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CAPRIN2Q6IMN6 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CAPRIN2Q6IMN6 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CAPRIN2Q6IMN6 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAPRIN2Q6IMN6 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CAPRIN2Q6IMN6 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CAPRIN2Q6IMN6 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAPRIN2Q6IMN6 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAPRIN2Q6IMN6 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAPRIN2Q6IMN6 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAPRIN2Q6IMN6 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CAPRIN2Q6IMN6 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CAPRIN2Q6IMN6 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CAPRIN2Q6IMN6 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CAPRIN2Q6IMN6 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CAPRIN2Q6IMN6 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CAPRIN2Q6IMN6 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CAPRIN2Q6IMN6 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CAPRIN2Q6IMN6 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CAPRIN2Q6IMN6 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CAPRIN2Q6IMN6 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CAPRIN2Q6IMN6 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CAPRIN2Q6IMN6 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CAPRIN2Q6IMN6 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CAPRIN2Q6IMN6 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAPRIN2Q6IMN6 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAPRIN2Q6IMN6 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAPRIN2Q6IMN6 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAPRIN2Q6IMN6 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAPRIN2Q6IMN6 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAPRIN2Q6IMN6 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAPRIN2Q6IMN6 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAPRIN2Q6IMN6 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAPRIN2Q6IMN6 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAPRIN2Q6IMN6 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAPRIN2Q6IMN6 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CAPRIN2Q6IMN6 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAPRIN2Q6IMN6 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAPRIN2Q6IMN6 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAPRIN2Q6IMN6 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CAPRIN2Q6IMN6 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CAPRIN2Q6IMN6 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CAPRIN2Q6IMN6 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CAPRIN2Q6IMN6 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CAPRIN2Q6IMN6 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CAPRIN2Q6IMN6 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CAPRIN2Q6IMN6 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms