Protein–RNA interactions for Protein: Q6GYQ0

RALGAPA1, Ral GTPase-activating protein subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 2,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALGAPA1Q6GYQ0 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RALGAPA1Q6GYQ0 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RALGAPA1Q6GYQ0 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RALGAPA1Q6GYQ0 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RALGAPA1Q6GYQ0 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RALGAPA1Q6GYQ0 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RALGAPA1Q6GYQ0 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RALGAPA1Q6GYQ0 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RALGAPA1Q6GYQ0 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RALGAPA1Q6GYQ0 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RALGAPA1Q6GYQ0 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
RALGAPA1Q6GYQ0 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RALGAPA1Q6GYQ0 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RALGAPA1Q6GYQ0 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RALGAPA1Q6GYQ0 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RALGAPA1Q6GYQ0 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
RALGAPA1Q6GYQ0 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RALGAPA1Q6GYQ0 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RALGAPA1Q6GYQ0 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RALGAPA1Q6GYQ0 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RALGAPA1Q6GYQ0 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
RALGAPA1Q6GYQ0 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RALGAPA1Q6GYQ0 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RALGAPA1Q6GYQ0 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
RALGAPA1Q6GYQ0 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RALGAPA1Q6GYQ0 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RALGAPA1Q6GYQ0 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RALGAPA1Q6GYQ0 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RALGAPA1Q6GYQ0 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
RALGAPA1Q6GYQ0 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RALGAPA1Q6GYQ0 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RALGAPA1Q6GYQ0 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RALGAPA1Q6GYQ0 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RALGAPA1Q6GYQ0 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RALGAPA1Q6GYQ0 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RALGAPA1Q6GYQ0 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RALGAPA1Q6GYQ0 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RALGAPA1Q6GYQ0 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RALGAPA1Q6GYQ0 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RALGAPA1Q6GYQ0 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RALGAPA1Q6GYQ0 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RALGAPA1Q6GYQ0 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RALGAPA1Q6GYQ0 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RALGAPA1Q6GYQ0 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RALGAPA1Q6GYQ0 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RALGAPA1Q6GYQ0 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RALGAPA1Q6GYQ0 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RALGAPA1Q6GYQ0 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RALGAPA1Q6GYQ0 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RALGAPA1Q6GYQ0 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RALGAPA1Q6GYQ0 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RALGAPA1Q6GYQ0 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RALGAPA1Q6GYQ0 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RALGAPA1Q6GYQ0 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RALGAPA1Q6GYQ0 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RALGAPA1Q6GYQ0 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RALGAPA1Q6GYQ0 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RALGAPA1Q6GYQ0 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RALGAPA1Q6GYQ0 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RALGAPA1Q6GYQ0 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RALGAPA1Q6GYQ0 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RALGAPA1Q6GYQ0 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RALGAPA1Q6GYQ0 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RALGAPA1Q6GYQ0 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RALGAPA1Q6GYQ0 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RALGAPA1Q6GYQ0 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RALGAPA1Q6GYQ0 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RALGAPA1Q6GYQ0 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RALGAPA1Q6GYQ0 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
RALGAPA1Q6GYQ0 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RALGAPA1Q6GYQ0 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RALGAPA1Q6GYQ0 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RALGAPA1Q6GYQ0 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RALGAPA1Q6GYQ0 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RALGAPA1Q6GYQ0 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RALGAPA1Q6GYQ0 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RALGAPA1Q6GYQ0 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RALGAPA1Q6GYQ0 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RALGAPA1Q6GYQ0 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RALGAPA1Q6GYQ0 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RALGAPA1Q6GYQ0 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RALGAPA1Q6GYQ0 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RALGAPA1Q6GYQ0 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RALGAPA1Q6GYQ0 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RALGAPA1Q6GYQ0 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RALGAPA1Q6GYQ0 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RALGAPA1Q6GYQ0 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RALGAPA1Q6GYQ0 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RALGAPA1Q6GYQ0 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RALGAPA1Q6GYQ0 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RALGAPA1Q6GYQ0 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RALGAPA1Q6GYQ0 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RALGAPA1Q6GYQ0 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RALGAPA1Q6GYQ0 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RALGAPA1Q6GYQ0 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RALGAPA1Q6GYQ0 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RALGAPA1Q6GYQ0 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RALGAPA1Q6GYQ0 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RALGAPA1Q6GYQ0 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RALGAPA1Q6GYQ0 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms