Protein–RNA interactions for Protein: Q6DKK2

TTC19, Tetratricopeptide repeat protein 19, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC19Q6DKK2 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TTC19Q6DKK2 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TTC19Q6DKK2 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TTC19Q6DKK2 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TTC19Q6DKK2 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TTC19Q6DKK2 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
TTC19Q6DKK2 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TTC19Q6DKK2 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TTC19Q6DKK2 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TTC19Q6DKK2 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TTC19Q6DKK2 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TTC19Q6DKK2 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TTC19Q6DKK2 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TTC19Q6DKK2 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TTC19Q6DKK2 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TTC19Q6DKK2 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TTC19Q6DKK2 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TTC19Q6DKK2 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TTC19Q6DKK2 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TTC19Q6DKK2 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TTC19Q6DKK2 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TTC19Q6DKK2 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TTC19Q6DKK2 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TTC19Q6DKK2 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TTC19Q6DKK2 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TTC19Q6DKK2 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TTC19Q6DKK2 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TTC19Q6DKK2 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TTC19Q6DKK2 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TTC19Q6DKK2 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TTC19Q6DKK2 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TTC19Q6DKK2 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TTC19Q6DKK2 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TTC19Q6DKK2 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TTC19Q6DKK2 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TTC19Q6DKK2 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TTC19Q6DKK2 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TTC19Q6DKK2 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TTC19Q6DKK2 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TTC19Q6DKK2 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TTC19Q6DKK2 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TTC19Q6DKK2 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TTC19Q6DKK2 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TTC19Q6DKK2 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TTC19Q6DKK2 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TTC19Q6DKK2 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TTC19Q6DKK2 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TTC19Q6DKK2 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TTC19Q6DKK2 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TTC19Q6DKK2 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TTC19Q6DKK2 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TTC19Q6DKK2 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TTC19Q6DKK2 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TTC19Q6DKK2 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TTC19Q6DKK2 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TTC19Q6DKK2 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TTC19Q6DKK2 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TTC19Q6DKK2 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TTC19Q6DKK2 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TTC19Q6DKK2 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TTC19Q6DKK2 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TTC19Q6DKK2 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TTC19Q6DKK2 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TTC19Q6DKK2 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TTC19Q6DKK2 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TTC19Q6DKK2 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TTC19Q6DKK2 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TTC19Q6DKK2 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TTC19Q6DKK2 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TTC19Q6DKK2 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TTC19Q6DKK2 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TTC19Q6DKK2 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TTC19Q6DKK2 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TTC19Q6DKK2 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TTC19Q6DKK2 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TTC19Q6DKK2 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TTC19Q6DKK2 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TTC19Q6DKK2 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TTC19Q6DKK2 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TTC19Q6DKK2 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TTC19Q6DKK2 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TTC19Q6DKK2 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TTC19Q6DKK2 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TTC19Q6DKK2 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TTC19Q6DKK2 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TTC19Q6DKK2 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TTC19Q6DKK2 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TTC19Q6DKK2 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TTC19Q6DKK2 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TTC19Q6DKK2 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TTC19Q6DKK2 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TTC19Q6DKK2 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TTC19Q6DKK2 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TTC19Q6DKK2 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TTC19Q6DKK2 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TTC19Q6DKK2 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TTC19Q6DKK2 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TTC19Q6DKK2 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TTC19Q6DKK2 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TTC19Q6DKK2 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms