Protein–RNA interactions for Protein: Q5VW22

AGAP6, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP6Q5VW22 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
AGAP6Q5VW22 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
AGAP6Q5VW22 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
AGAP6Q5VW22 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
AGAP6Q5VW22 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
AGAP6Q5VW22 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
AGAP6Q5VW22 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
AGAP6Q5VW22 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
AGAP6Q5VW22 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
AGAP6Q5VW22 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
AGAP6Q5VW22 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
AGAP6Q5VW22 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
AGAP6Q5VW22 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
AGAP6Q5VW22 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
AGAP6Q5VW22 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
AGAP6Q5VW22 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
AGAP6Q5VW22 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
AGAP6Q5VW22 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
AGAP6Q5VW22 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
AGAP6Q5VW22 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
AGAP6Q5VW22 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
AGAP6Q5VW22 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
AGAP6Q5VW22 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
AGAP6Q5VW22 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
AGAP6Q5VW22 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
AGAP6Q5VW22 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
AGAP6Q5VW22 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
AGAP6Q5VW22 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
AGAP6Q5VW22 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
AGAP6Q5VW22 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
AGAP6Q5VW22 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
AGAP6Q5VW22 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
AGAP6Q5VW22 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
AGAP6Q5VW22 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
AGAP6Q5VW22 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
AGAP6Q5VW22 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
AGAP6Q5VW22 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
AGAP6Q5VW22 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
AGAP6Q5VW22 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
AGAP6Q5VW22 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
AGAP6Q5VW22 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
AGAP6Q5VW22 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
AGAP6Q5VW22 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
AGAP6Q5VW22 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
AGAP6Q5VW22 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
AGAP6Q5VW22 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
AGAP6Q5VW22 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
AGAP6Q5VW22 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
AGAP6Q5VW22 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
AGAP6Q5VW22 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
AGAP6Q5VW22 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
AGAP6Q5VW22 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
AGAP6Q5VW22 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
AGAP6Q5VW22 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
AGAP6Q5VW22 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
AGAP6Q5VW22 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
AGAP6Q5VW22 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
AGAP6Q5VW22 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
AGAP6Q5VW22 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
AGAP6Q5VW22 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
AGAP6Q5VW22 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
AGAP6Q5VW22 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
AGAP6Q5VW22 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
AGAP6Q5VW22 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
AGAP6Q5VW22 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
AGAP6Q5VW22 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
AGAP6Q5VW22 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
AGAP6Q5VW22 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
AGAP6Q5VW22 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
AGAP6Q5VW22 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
AGAP6Q5VW22 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
AGAP6Q5VW22 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
AGAP6Q5VW22 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
AGAP6Q5VW22 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
AGAP6Q5VW22 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
AGAP6Q5VW22 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
AGAP6Q5VW22 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
AGAP6Q5VW22 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
AGAP6Q5VW22 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
AGAP6Q5VW22 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
AGAP6Q5VW22 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
AGAP6Q5VW22 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
AGAP6Q5VW22 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
AGAP6Q5VW22 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
AGAP6Q5VW22 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
AGAP6Q5VW22 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
AGAP6Q5VW22 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
AGAP6Q5VW22 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
AGAP6Q5VW22 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
AGAP6Q5VW22 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
AGAP6Q5VW22 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
AGAP6Q5VW22 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
AGAP6Q5VW22 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
AGAP6Q5VW22 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
AGAP6Q5VW22 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
AGAP6Q5VW22 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
AGAP6Q5VW22 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
AGAP6Q5VW22 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
AGAP6Q5VW22 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
AGAP6Q5VW22 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms