Protein–RNA interactions for Protein: Q5VU43

PDE4DIP, Myomegalin, humanhuman

Predictions only

Length 2,346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DIPQ5VU43 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PDE4DIPQ5VU43 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDE4DIPQ5VU43 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDE4DIPQ5VU43 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDE4DIPQ5VU43 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDE4DIPQ5VU43 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PDE4DIPQ5VU43 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDE4DIPQ5VU43 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDE4DIPQ5VU43 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDE4DIPQ5VU43 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDE4DIPQ5VU43 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDE4DIPQ5VU43 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDE4DIPQ5VU43 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDE4DIPQ5VU43 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDE4DIPQ5VU43 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDE4DIPQ5VU43 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDE4DIPQ5VU43 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDE4DIPQ5VU43 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PDE4DIPQ5VU43 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDE4DIPQ5VU43 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PDE4DIPQ5VU43 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDE4DIPQ5VU43 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDE4DIPQ5VU43 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDE4DIPQ5VU43 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDE4DIPQ5VU43 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDE4DIPQ5VU43 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDE4DIPQ5VU43 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDE4DIPQ5VU43 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDE4DIPQ5VU43 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDE4DIPQ5VU43 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDE4DIPQ5VU43 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDE4DIPQ5VU43 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDE4DIPQ5VU43 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDE4DIPQ5VU43 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDE4DIPQ5VU43 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDE4DIPQ5VU43 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PDE4DIPQ5VU43 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PDE4DIPQ5VU43 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PDE4DIPQ5VU43 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PDE4DIPQ5VU43 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PDE4DIPQ5VU43 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PDE4DIPQ5VU43 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PDE4DIPQ5VU43 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PDE4DIPQ5VU43 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PDE4DIPQ5VU43 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PDE4DIPQ5VU43 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PDE4DIPQ5VU43 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
PDE4DIPQ5VU43 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PDE4DIPQ5VU43 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PDE4DIPQ5VU43 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PDE4DIPQ5VU43 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PDE4DIPQ5VU43 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PDE4DIPQ5VU43 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PDE4DIPQ5VU43 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PDE4DIPQ5VU43 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PDE4DIPQ5VU43 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PDE4DIPQ5VU43 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PDE4DIPQ5VU43 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PDE4DIPQ5VU43 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PDE4DIPQ5VU43 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
PDE4DIPQ5VU43 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PDE4DIPQ5VU43 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PDE4DIPQ5VU43 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PDE4DIPQ5VU43 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PDE4DIPQ5VU43 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PDE4DIPQ5VU43 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PDE4DIPQ5VU43 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
PDE4DIPQ5VU43 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
PDE4DIPQ5VU43 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PDE4DIPQ5VU43 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PDE4DIPQ5VU43 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PDE4DIPQ5VU43 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PDE4DIPQ5VU43 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PDE4DIPQ5VU43 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
PDE4DIPQ5VU43 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
PDE4DIPQ5VU43 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PDE4DIPQ5VU43 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PDE4DIPQ5VU43 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDE4DIPQ5VU43 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDE4DIPQ5VU43 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PDE4DIPQ5VU43 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PDE4DIPQ5VU43 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
PDE4DIPQ5VU43 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PDE4DIPQ5VU43 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PDE4DIPQ5VU43 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PDE4DIPQ5VU43 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PDE4DIPQ5VU43 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PDE4DIPQ5VU43 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PDE4DIPQ5VU43 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
PDE4DIPQ5VU43 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PDE4DIPQ5VU43 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PDE4DIPQ5VU43 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
PDE4DIPQ5VU43 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PDE4DIPQ5VU43 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PDE4DIPQ5VU43 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PDE4DIPQ5VU43 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PDE4DIPQ5VU43 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PDE4DIPQ5VU43 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PDE4DIPQ5VU43 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PDE4DIPQ5VU43 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
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