Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGY1

TMCO4, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO4Q5TGY1 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMCO4Q5TGY1 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMCO4Q5TGY1 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMCO4Q5TGY1 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMCO4Q5TGY1 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMCO4Q5TGY1 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMCO4Q5TGY1 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMCO4Q5TGY1 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMCO4Q5TGY1 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMCO4Q5TGY1 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMCO4Q5TGY1 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMCO4Q5TGY1 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMCO4Q5TGY1 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMCO4Q5TGY1 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMCO4Q5TGY1 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMCO4Q5TGY1 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMCO4Q5TGY1 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMCO4Q5TGY1 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMCO4Q5TGY1 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMCO4Q5TGY1 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMCO4Q5TGY1 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMCO4Q5TGY1 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMCO4Q5TGY1 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMCO4Q5TGY1 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMCO4Q5TGY1 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMCO4Q5TGY1 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMCO4Q5TGY1 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMCO4Q5TGY1 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMCO4Q5TGY1 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMCO4Q5TGY1 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMCO4Q5TGY1 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMCO4Q5TGY1 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMCO4Q5TGY1 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMCO4Q5TGY1 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMCO4Q5TGY1 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMCO4Q5TGY1 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMCO4Q5TGY1 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMCO4Q5TGY1 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMCO4Q5TGY1 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMCO4Q5TGY1 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMCO4Q5TGY1 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMCO4Q5TGY1 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMCO4Q5TGY1 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMCO4Q5TGY1 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMCO4Q5TGY1 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMCO4Q5TGY1 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMCO4Q5TGY1 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMCO4Q5TGY1 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TMCO4Q5TGY1 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TMCO4Q5TGY1 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMCO4Q5TGY1 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMCO4Q5TGY1 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMCO4Q5TGY1 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMCO4Q5TGY1 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMCO4Q5TGY1 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMCO4Q5TGY1 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMCO4Q5TGY1 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TMCO4Q5TGY1 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMCO4Q5TGY1 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMCO4Q5TGY1 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMCO4Q5TGY1 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMCO4Q5TGY1 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMCO4Q5TGY1 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMCO4Q5TGY1 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMCO4Q5TGY1 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMCO4Q5TGY1 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMCO4Q5TGY1 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMCO4Q5TGY1 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMCO4Q5TGY1 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMCO4Q5TGY1 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMCO4Q5TGY1 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMCO4Q5TGY1 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TMCO4Q5TGY1 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMCO4Q5TGY1 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMCO4Q5TGY1 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMCO4Q5TGY1 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMCO4Q5TGY1 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMCO4Q5TGY1 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMCO4Q5TGY1 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMCO4Q5TGY1 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMCO4Q5TGY1 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMCO4Q5TGY1 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TMCO4Q5TGY1 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMCO4Q5TGY1 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMCO4Q5TGY1 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMCO4Q5TGY1 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMCO4Q5TGY1 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMCO4Q5TGY1 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMCO4Q5TGY1 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMCO4Q5TGY1 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMCO4Q5TGY1 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMCO4Q5TGY1 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMCO4Q5TGY1 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMCO4Q5TGY1 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMCO4Q5TGY1 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMCO4Q5TGY1 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMCO4Q5TGY1 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMCO4Q5TGY1 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMCO4Q5TGY1 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMCO4Q5TGY1 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms