Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGS1

HES3, Transcription factor HES-3, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HES3Q5TGS1 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HES3Q5TGS1 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HES3Q5TGS1 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
HES3Q5TGS1 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HES3Q5TGS1 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HES3Q5TGS1 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HES3Q5TGS1 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HES3Q5TGS1 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HES3Q5TGS1 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HES3Q5TGS1 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HES3Q5TGS1 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HES3Q5TGS1 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
HES3Q5TGS1 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HES3Q5TGS1 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HES3Q5TGS1 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
HES3Q5TGS1 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HES3Q5TGS1 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HES3Q5TGS1 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HES3Q5TGS1 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
HES3Q5TGS1 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HES3Q5TGS1 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HES3Q5TGS1 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HES3Q5TGS1 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HES3Q5TGS1 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HES3Q5TGS1 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HES3Q5TGS1 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HES3Q5TGS1 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HES3Q5TGS1 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HES3Q5TGS1 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HES3Q5TGS1 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HES3Q5TGS1 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HES3Q5TGS1 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HES3Q5TGS1 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HES3Q5TGS1 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HES3Q5TGS1 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HES3Q5TGS1 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HES3Q5TGS1 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HES3Q5TGS1 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HES3Q5TGS1 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HES3Q5TGS1 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HES3Q5TGS1 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HES3Q5TGS1 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HES3Q5TGS1 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HES3Q5TGS1 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HES3Q5TGS1 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HES3Q5TGS1 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HES3Q5TGS1 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
HES3Q5TGS1 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HES3Q5TGS1 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HES3Q5TGS1 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HES3Q5TGS1 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HES3Q5TGS1 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HES3Q5TGS1 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HES3Q5TGS1 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HES3Q5TGS1 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HES3Q5TGS1 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HES3Q5TGS1 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HES3Q5TGS1 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
HES3Q5TGS1 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HES3Q5TGS1 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HES3Q5TGS1 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HES3Q5TGS1 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HES3Q5TGS1 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HES3Q5TGS1 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HES3Q5TGS1 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HES3Q5TGS1 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HES3Q5TGS1 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HES3Q5TGS1 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
HES3Q5TGS1 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HES3Q5TGS1 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HES3Q5TGS1 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HES3Q5TGS1 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HES3Q5TGS1 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HES3Q5TGS1 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HES3Q5TGS1 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
HES3Q5TGS1 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
HES3Q5TGS1 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HES3Q5TGS1 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HES3Q5TGS1 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HES3Q5TGS1 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HES3Q5TGS1 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HES3Q5TGS1 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HES3Q5TGS1 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HES3Q5TGS1 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HES3Q5TGS1 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HES3Q5TGS1 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
HES3Q5TGS1 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HES3Q5TGS1 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HES3Q5TGS1 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HES3Q5TGS1 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HES3Q5TGS1 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HES3Q5TGS1 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HES3Q5TGS1 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HES3Q5TGS1 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HES3Q5TGS1 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HES3Q5TGS1 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HES3Q5TGS1 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HES3Q5TGS1 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HES3Q5TGS1 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HES3Q5TGS1 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms