Protein–RNA interactions for Protein: Q5TF21

SOGA3, Protein SOGA3, humanhuman

Predictions only

Length 947 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOGA3Q5TF21 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SOGA3Q5TF21 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SOGA3Q5TF21 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SOGA3Q5TF21 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SOGA3Q5TF21 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SOGA3Q5TF21 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
SOGA3Q5TF21 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SOGA3Q5TF21 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SOGA3Q5TF21 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SOGA3Q5TF21 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
SOGA3Q5TF21 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SOGA3Q5TF21 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SOGA3Q5TF21 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SOGA3Q5TF21 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SOGA3Q5TF21 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SOGA3Q5TF21 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SOGA3Q5TF21 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SOGA3Q5TF21 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SOGA3Q5TF21 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SOGA3Q5TF21 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SOGA3Q5TF21 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SOGA3Q5TF21 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SOGA3Q5TF21 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SOGA3Q5TF21 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SOGA3Q5TF21 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SOGA3Q5TF21 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SOGA3Q5TF21 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SOGA3Q5TF21 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SOGA3Q5TF21 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SOGA3Q5TF21 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SOGA3Q5TF21 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SOGA3Q5TF21 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SOGA3Q5TF21 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SOGA3Q5TF21 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SOGA3Q5TF21 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SOGA3Q5TF21 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SOGA3Q5TF21 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SOGA3Q5TF21 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SOGA3Q5TF21 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SOGA3Q5TF21 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SOGA3Q5TF21 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SOGA3Q5TF21 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SOGA3Q5TF21 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SOGA3Q5TF21 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SOGA3Q5TF21 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SOGA3Q5TF21 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SOGA3Q5TF21 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SOGA3Q5TF21 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SOGA3Q5TF21 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SOGA3Q5TF21 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SOGA3Q5TF21 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SOGA3Q5TF21 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SOGA3Q5TF21 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SOGA3Q5TF21 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SOGA3Q5TF21 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SOGA3Q5TF21 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SOGA3Q5TF21 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SOGA3Q5TF21 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SOGA3Q5TF21 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SOGA3Q5TF21 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SOGA3Q5TF21 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SOGA3Q5TF21 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SOGA3Q5TF21 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SOGA3Q5TF21 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SOGA3Q5TF21 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SOGA3Q5TF21 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SOGA3Q5TF21 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SOGA3Q5TF21 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SOGA3Q5TF21 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SOGA3Q5TF21 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SOGA3Q5TF21 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SOGA3Q5TF21 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SOGA3Q5TF21 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SOGA3Q5TF21 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SOGA3Q5TF21 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SOGA3Q5TF21 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SOGA3Q5TF21 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
SOGA3Q5TF21 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SOGA3Q5TF21 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SOGA3Q5TF21 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SOGA3Q5TF21 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SOGA3Q5TF21 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SOGA3Q5TF21 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SOGA3Q5TF21 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SOGA3Q5TF21 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SOGA3Q5TF21 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SOGA3Q5TF21 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.76■■■□□ 2.04
SOGA3Q5TF21 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SOGA3Q5TF21 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SOGA3Q5TF21 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SOGA3Q5TF21 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SOGA3Q5TF21 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SOGA3Q5TF21 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SOGA3Q5TF21 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SOGA3Q5TF21 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SOGA3Q5TF21 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SOGA3Q5TF21 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SOGA3Q5TF21 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SOGA3Q5TF21 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SOGA3Q5TF21 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms