Protein–RNA interactions for Protein: Q5T7P6

TMEM78, Transmembrane protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM78Q5T7P6 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMEM78Q5T7P6 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMEM78Q5T7P6 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMEM78Q5T7P6 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMEM78Q5T7P6 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
TMEM78Q5T7P6 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMEM78Q5T7P6 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMEM78Q5T7P6 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
TMEM78Q5T7P6 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
TMEM78Q5T7P6 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
TMEM78Q5T7P6 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
TMEM78Q5T7P6 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
TMEM78Q5T7P6 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
TMEM78Q5T7P6 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
TMEM78Q5T7P6 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
TMEM78Q5T7P6 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMEM78Q5T7P6 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMEM78Q5T7P6 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMEM78Q5T7P6 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMEM78Q5T7P6 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMEM78Q5T7P6 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMEM78Q5T7P6 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMEM78Q5T7P6 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMEM78Q5T7P6 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMEM78Q5T7P6 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
TMEM78Q5T7P6 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMEM78Q5T7P6 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMEM78Q5T7P6 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMEM78Q5T7P6 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
TMEM78Q5T7P6 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMEM78Q5T7P6 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMEM78Q5T7P6 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMEM78Q5T7P6 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMEM78Q5T7P6 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMEM78Q5T7P6 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMEM78Q5T7P6 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMEM78Q5T7P6 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMEM78Q5T7P6 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMEM78Q5T7P6 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMEM78Q5T7P6 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMEM78Q5T7P6 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMEM78Q5T7P6 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMEM78Q5T7P6 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMEM78Q5T7P6 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMEM78Q5T7P6 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMEM78Q5T7P6 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMEM78Q5T7P6 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMEM78Q5T7P6 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMEM78Q5T7P6 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMEM78Q5T7P6 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMEM78Q5T7P6 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
TMEM78Q5T7P6 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMEM78Q5T7P6 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMEM78Q5T7P6 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMEM78Q5T7P6 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMEM78Q5T7P6 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMEM78Q5T7P6 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMEM78Q5T7P6 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMEM78Q5T7P6 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMEM78Q5T7P6 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TMEM78Q5T7P6 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TMEM78Q5T7P6 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TMEM78Q5T7P6 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TMEM78Q5T7P6 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TMEM78Q5T7P6 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TMEM78Q5T7P6 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TMEM78Q5T7P6 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TMEM78Q5T7P6 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TMEM78Q5T7P6 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TMEM78Q5T7P6 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TMEM78Q5T7P6 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TMEM78Q5T7P6 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TMEM78Q5T7P6 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TMEM78Q5T7P6 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TMEM78Q5T7P6 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TMEM78Q5T7P6 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TMEM78Q5T7P6 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TMEM78Q5T7P6 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TMEM78Q5T7P6 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TMEM78Q5T7P6 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TMEM78Q5T7P6 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TMEM78Q5T7P6 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TMEM78Q5T7P6 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TMEM78Q5T7P6 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TMEM78Q5T7P6 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TMEM78Q5T7P6 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TMEM78Q5T7P6 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TMEM78Q5T7P6 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TMEM78Q5T7P6 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TMEM78Q5T7P6 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TMEM78Q5T7P6 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TMEM78Q5T7P6 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TMEM78Q5T7P6 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TMEM78Q5T7P6 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TMEM78Q5T7P6 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
TMEM78Q5T7P6 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TMEM78Q5T7P6 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TMEM78Q5T7P6 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TMEM78Q5T7P6 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TMEM78Q5T7P6 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms