Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJD5

TMEM41B, Transmembrane protein 41B, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM41BQ5BJD5 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM41BQ5BJD5 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM41BQ5BJD5 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM41BQ5BJD5 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM41BQ5BJD5 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM41BQ5BJD5 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM41BQ5BJD5 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM41BQ5BJD5 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM41BQ5BJD5 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM41BQ5BJD5 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM41BQ5BJD5 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM41BQ5BJD5 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM41BQ5BJD5 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM41BQ5BJD5 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMEM41BQ5BJD5 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMEM41BQ5BJD5 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TMEM41BQ5BJD5 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMEM41BQ5BJD5 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMEM41BQ5BJD5 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TMEM41BQ5BJD5 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TMEM41BQ5BJD5 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TMEM41BQ5BJD5 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TMEM41BQ5BJD5 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM41BQ5BJD5 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM41BQ5BJD5 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM41BQ5BJD5 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM41BQ5BJD5 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM41BQ5BJD5 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM41BQ5BJD5 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM41BQ5BJD5 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM41BQ5BJD5 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM41BQ5BJD5 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM41BQ5BJD5 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM41BQ5BJD5 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM41BQ5BJD5 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM41BQ5BJD5 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM41BQ5BJD5 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM41BQ5BJD5 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM41BQ5BJD5 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM41BQ5BJD5 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM41BQ5BJD5 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM41BQ5BJD5 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM41BQ5BJD5 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM41BQ5BJD5 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM41BQ5BJD5 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM41BQ5BJD5 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM41BQ5BJD5 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM41BQ5BJD5 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM41BQ5BJD5 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM41BQ5BJD5 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM41BQ5BJD5 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM41BQ5BJD5 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM41BQ5BJD5 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM41BQ5BJD5 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM41BQ5BJD5 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM41BQ5BJD5 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM41BQ5BJD5 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM41BQ5BJD5 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM41BQ5BJD5 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM41BQ5BJD5 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TMEM41BQ5BJD5 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM41BQ5BJD5 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM41BQ5BJD5 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM41BQ5BJD5 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM41BQ5BJD5 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM41BQ5BJD5 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM41BQ5BJD5 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM41BQ5BJD5 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM41BQ5BJD5 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM41BQ5BJD5 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM41BQ5BJD5 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM41BQ5BJD5 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM41BQ5BJD5 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM41BQ5BJD5 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM41BQ5BJD5 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM41BQ5BJD5 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM41BQ5BJD5 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM41BQ5BJD5 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM41BQ5BJD5 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM41BQ5BJD5 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM41BQ5BJD5 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM41BQ5BJD5 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM41BQ5BJD5 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM41BQ5BJD5 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM41BQ5BJD5 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM41BQ5BJD5 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM41BQ5BJD5 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM41BQ5BJD5 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM41BQ5BJD5 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM41BQ5BJD5 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM41BQ5BJD5 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM41BQ5BJD5 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM41BQ5BJD5 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM41BQ5BJD5 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM41BQ5BJD5 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMEM41BQ5BJD5 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMEM41BQ5BJD5 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMEM41BQ5BJD5 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
TMEM41BQ5BJD5 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMEM41BQ5BJD5 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.6 ms