Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDE5

SVEP1, Sushi, von Willebrand factor type A, EGF and pentraxin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 3,571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVEP1Q4LDE5 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SVEP1Q4LDE5 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SVEP1Q4LDE5 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SVEP1Q4LDE5 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SVEP1Q4LDE5 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SVEP1Q4LDE5 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SVEP1Q4LDE5 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SVEP1Q4LDE5 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SVEP1Q4LDE5 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SVEP1Q4LDE5 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SVEP1Q4LDE5 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SVEP1Q4LDE5 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SVEP1Q4LDE5 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SVEP1Q4LDE5 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SVEP1Q4LDE5 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SVEP1Q4LDE5 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SVEP1Q4LDE5 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SVEP1Q4LDE5 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SVEP1Q4LDE5 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SVEP1Q4LDE5 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SVEP1Q4LDE5 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SVEP1Q4LDE5 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SVEP1Q4LDE5 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SVEP1Q4LDE5 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SVEP1Q4LDE5 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SVEP1Q4LDE5 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SVEP1Q4LDE5 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SVEP1Q4LDE5 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SVEP1Q4LDE5 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SVEP1Q4LDE5 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SVEP1Q4LDE5 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
SVEP1Q4LDE5 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SVEP1Q4LDE5 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SVEP1Q4LDE5 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SVEP1Q4LDE5 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SVEP1Q4LDE5 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SVEP1Q4LDE5 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SVEP1Q4LDE5 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SVEP1Q4LDE5 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SVEP1Q4LDE5 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SVEP1Q4LDE5 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SVEP1Q4LDE5 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SVEP1Q4LDE5 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SVEP1Q4LDE5 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SVEP1Q4LDE5 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SVEP1Q4LDE5 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SVEP1Q4LDE5 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SVEP1Q4LDE5 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SVEP1Q4LDE5 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SVEP1Q4LDE5 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SVEP1Q4LDE5 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SVEP1Q4LDE5 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SVEP1Q4LDE5 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SVEP1Q4LDE5 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SVEP1Q4LDE5 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SVEP1Q4LDE5 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SVEP1Q4LDE5 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SVEP1Q4LDE5 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SVEP1Q4LDE5 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SVEP1Q4LDE5 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SVEP1Q4LDE5 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SVEP1Q4LDE5 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SVEP1Q4LDE5 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SVEP1Q4LDE5 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SVEP1Q4LDE5 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SVEP1Q4LDE5 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SVEP1Q4LDE5 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SVEP1Q4LDE5 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SVEP1Q4LDE5 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SVEP1Q4LDE5 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SVEP1Q4LDE5 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SVEP1Q4LDE5 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SVEP1Q4LDE5 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SVEP1Q4LDE5 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SVEP1Q4LDE5 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SVEP1Q4LDE5 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SVEP1Q4LDE5 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SVEP1Q4LDE5 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SVEP1Q4LDE5 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SVEP1Q4LDE5 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SVEP1Q4LDE5 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SVEP1Q4LDE5 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SVEP1Q4LDE5 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SVEP1Q4LDE5 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SVEP1Q4LDE5 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SVEP1Q4LDE5 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SVEP1Q4LDE5 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SVEP1Q4LDE5 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SVEP1Q4LDE5 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SVEP1Q4LDE5 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SVEP1Q4LDE5 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SVEP1Q4LDE5 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SVEP1Q4LDE5 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SVEP1Q4LDE5 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SVEP1Q4LDE5 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SVEP1Q4LDE5 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SVEP1Q4LDE5 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SVEP1Q4LDE5 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SVEP1Q4LDE5 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SVEP1Q4LDE5 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms