Protein–RNA interactions for Protein: Q496J9

SV2C, Synaptic vesicle glycoprotein 2C, humanhuman

Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SV2CQ496J9 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SV2CQ496J9 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SV2CQ496J9 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SV2CQ496J9 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SV2CQ496J9 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SV2CQ496J9 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SV2CQ496J9 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SV2CQ496J9 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SV2CQ496J9 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SV2CQ496J9 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SV2CQ496J9 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SV2CQ496J9 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SV2CQ496J9 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SV2CQ496J9 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SV2CQ496J9 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SV2CQ496J9 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SV2CQ496J9 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SV2CQ496J9 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SV2CQ496J9 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SV2CQ496J9 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SV2CQ496J9 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SV2CQ496J9 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SV2CQ496J9 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SV2CQ496J9 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SV2CQ496J9 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SV2CQ496J9 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SV2CQ496J9 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SV2CQ496J9 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SV2CQ496J9 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SV2CQ496J9 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SV2CQ496J9 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SV2CQ496J9 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SV2CQ496J9 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SV2CQ496J9 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SV2CQ496J9 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SV2CQ496J9 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SV2CQ496J9 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SV2CQ496J9 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SV2CQ496J9 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SV2CQ496J9 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SV2CQ496J9 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SV2CQ496J9 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SV2CQ496J9 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SV2CQ496J9 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SV2CQ496J9 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SV2CQ496J9 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SV2CQ496J9 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SV2CQ496J9 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SV2CQ496J9 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SV2CQ496J9 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SV2CQ496J9 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SV2CQ496J9 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SV2CQ496J9 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SV2CQ496J9 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SV2CQ496J9 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SV2CQ496J9 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SV2CQ496J9 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SV2CQ496J9 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SV2CQ496J9 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SV2CQ496J9 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SV2CQ496J9 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SV2CQ496J9 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SV2CQ496J9 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SV2CQ496J9 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SV2CQ496J9 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SV2CQ496J9 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SV2CQ496J9 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SV2CQ496J9 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SV2CQ496J9 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SV2CQ496J9 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SV2CQ496J9 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SV2CQ496J9 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SV2CQ496J9 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SV2CQ496J9 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SV2CQ496J9 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SV2CQ496J9 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SV2CQ496J9 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SV2CQ496J9 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SV2CQ496J9 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SV2CQ496J9 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SV2CQ496J9 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SV2CQ496J9 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SV2CQ496J9 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SV2CQ496J9 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SV2CQ496J9 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SV2CQ496J9 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SV2CQ496J9 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SV2CQ496J9 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SV2CQ496J9 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SV2CQ496J9 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SV2CQ496J9 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SV2CQ496J9 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SV2CQ496J9 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SV2CQ496J9 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SV2CQ496J9 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SV2CQ496J9 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SV2CQ496J9 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SV2CQ496J9 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SV2CQ496J9 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SV2CQ496J9 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms