Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYG4

BBS9, Protein PTHB1, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS9Q3SYG4 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
BBS9Q3SYG4 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
BBS9Q3SYG4 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BBS9Q3SYG4 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BBS9Q3SYG4 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BBS9Q3SYG4 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BBS9Q3SYG4 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BBS9Q3SYG4 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BBS9Q3SYG4 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BBS9Q3SYG4 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BBS9Q3SYG4 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BBS9Q3SYG4 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BBS9Q3SYG4 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BBS9Q3SYG4 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BBS9Q3SYG4 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
BBS9Q3SYG4 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BBS9Q3SYG4 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BBS9Q3SYG4 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BBS9Q3SYG4 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BBS9Q3SYG4 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BBS9Q3SYG4 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
BBS9Q3SYG4 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
BBS9Q3SYG4 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
BBS9Q3SYG4 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
BBS9Q3SYG4 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
BBS9Q3SYG4 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BBS9Q3SYG4 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BBS9Q3SYG4 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
BBS9Q3SYG4 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
BBS9Q3SYG4 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BBS9Q3SYG4 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
BBS9Q3SYG4 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
BBS9Q3SYG4 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BBS9Q3SYG4 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
BBS9Q3SYG4 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BBS9Q3SYG4 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
BBS9Q3SYG4 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
BBS9Q3SYG4 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BBS9Q3SYG4 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BBS9Q3SYG4 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BBS9Q3SYG4 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BBS9Q3SYG4 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BBS9Q3SYG4 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BBS9Q3SYG4 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
BBS9Q3SYG4 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BBS9Q3SYG4 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BBS9Q3SYG4 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BBS9Q3SYG4 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BBS9Q3SYG4 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
BBS9Q3SYG4 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BBS9Q3SYG4 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BBS9Q3SYG4 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BBS9Q3SYG4 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BBS9Q3SYG4 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BBS9Q3SYG4 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BBS9Q3SYG4 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BBS9Q3SYG4 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BBS9Q3SYG4 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BBS9Q3SYG4 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BBS9Q3SYG4 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BBS9Q3SYG4 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BBS9Q3SYG4 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BBS9Q3SYG4 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BBS9Q3SYG4 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BBS9Q3SYG4 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BBS9Q3SYG4 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BBS9Q3SYG4 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BBS9Q3SYG4 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BBS9Q3SYG4 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BBS9Q3SYG4 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BBS9Q3SYG4 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BBS9Q3SYG4 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BBS9Q3SYG4 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BBS9Q3SYG4 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BBS9Q3SYG4 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BBS9Q3SYG4 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BBS9Q3SYG4 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BBS9Q3SYG4 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BBS9Q3SYG4 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BBS9Q3SYG4 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
BBS9Q3SYG4 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BBS9Q3SYG4 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BBS9Q3SYG4 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BBS9Q3SYG4 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BBS9Q3SYG4 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BBS9Q3SYG4 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BBS9Q3SYG4 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BBS9Q3SYG4 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BBS9Q3SYG4 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
BBS9Q3SYG4 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BBS9Q3SYG4 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BBS9Q3SYG4 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
BBS9Q3SYG4 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
BBS9Q3SYG4 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BBS9Q3SYG4 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BBS9Q3SYG4 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BBS9Q3SYG4 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BBS9Q3SYG4 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BBS9Q3SYG4 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BBS9Q3SYG4 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms