Protein–RNA interactions for Protein: Q16881

TXNRD1, Thioredoxin reductase 1, cytoplasmic, humanhuman

Predictions only

Length 649 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNRD1Q16881 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
TXNRD1Q16881 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
TXNRD1Q16881 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TXNRD1Q16881 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
TXNRD1Q16881 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TXNRD1Q16881 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TXNRD1Q16881 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
TXNRD1Q16881 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
TXNRD1Q16881 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
TXNRD1Q16881 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
TXNRD1Q16881 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
TXNRD1Q16881 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
TXNRD1Q16881 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
TXNRD1Q16881 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
TXNRD1Q16881 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TXNRD1Q16881 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TXNRD1Q16881 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TXNRD1Q16881 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
TXNRD1Q16881 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
TXNRD1Q16881 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TXNRD1Q16881 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
TXNRD1Q16881 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
TXNRD1Q16881 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
TXNRD1Q16881 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.26
TXNRD1Q16881 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
TXNRD1Q16881 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
TXNRD1Q16881 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
TXNRD1Q16881 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
TXNRD1Q16881 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
TXNRD1Q16881 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
TXNRD1Q16881 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.26
TXNRD1Q16881 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
TXNRD1Q16881 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
TXNRD1Q16881 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
TXNRD1Q16881 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
TXNRD1Q16881 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
TXNRD1Q16881 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC29.13■■■□□ 2.25
TXNRD1Q16881 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TXNRD1Q16881 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
TXNRD1Q16881 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TXNRD1Q16881 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
TXNRD1Q16881 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TXNRD1Q16881 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TXNRD1Q16881 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
TXNRD1Q16881 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TXNRD1Q16881 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TXNRD1Q16881 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TXNRD1Q16881 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TXNRD1Q16881 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TXNRD1Q16881 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
TXNRD1Q16881 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
TXNRD1Q16881 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
TXNRD1Q16881 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
TXNRD1Q16881 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
TXNRD1Q16881 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TXNRD1Q16881 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TXNRD1Q16881 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TXNRD1Q16881 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TXNRD1Q16881 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TXNRD1Q16881 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TXNRD1Q16881 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TXNRD1Q16881 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TXNRD1Q16881 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TXNRD1Q16881 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TXNRD1Q16881 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TXNRD1Q16881 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TXNRD1Q16881 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TXNRD1Q16881 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TXNRD1Q16881 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TXNRD1Q16881 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
TXNRD1Q16881 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TXNRD1Q16881 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TXNRD1Q16881 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TXNRD1Q16881 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TXNRD1Q16881 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TXNRD1Q16881 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
TXNRD1Q16881 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
TXNRD1Q16881 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
TXNRD1Q16881 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
TXNRD1Q16881 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
TXNRD1Q16881 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TXNRD1Q16881 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TXNRD1Q16881 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
TXNRD1Q16881 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TXNRD1Q16881 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
TXNRD1Q16881 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TXNRD1Q16881 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TXNRD1Q16881 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TXNRD1Q16881 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TXNRD1Q16881 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TXNRD1Q16881 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TXNRD1Q16881 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TXNRD1Q16881 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TXNRD1Q16881 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TXNRD1Q16881 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TXNRD1Q16881 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TXNRD1Q16881 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TXNRD1Q16881 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TXNRD1Q16881 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TXNRD1Q16881 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms