Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDO1Q16878 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDO1Q16878 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDO1Q16878 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDO1Q16878 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDO1Q16878 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDO1Q16878 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDO1Q16878 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDO1Q16878 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CDO1Q16878 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CDO1Q16878 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CDO1Q16878 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CDO1Q16878 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDO1Q16878 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDO1Q16878 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDO1Q16878 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CDO1Q16878 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDO1Q16878 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDO1Q16878 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDO1Q16878 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDO1Q16878 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDO1Q16878 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDO1Q16878 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDO1Q16878 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDO1Q16878 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDO1Q16878 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDO1Q16878 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDO1Q16878 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDO1Q16878 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDO1Q16878 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDO1Q16878 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDO1Q16878 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDO1Q16878 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDO1Q16878 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CDO1Q16878 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDO1Q16878 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDO1Q16878 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDO1Q16878 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDO1Q16878 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDO1Q16878 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDO1Q16878 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDO1Q16878 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDO1Q16878 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDO1Q16878 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDO1Q16878 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDO1Q16878 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDO1Q16878 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDO1Q16878 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDO1Q16878 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDO1Q16878 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDO1Q16878 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDO1Q16878 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDO1Q16878 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CDO1Q16878 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CDO1Q16878 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDO1Q16878 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDO1Q16878 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDO1Q16878 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDO1Q16878 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDO1Q16878 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDO1Q16878 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDO1Q16878 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDO1Q16878 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDO1Q16878 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDO1Q16878 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDO1Q16878 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDO1Q16878 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDO1Q16878 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CDO1Q16878 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDO1Q16878 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDO1Q16878 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDO1Q16878 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDO1Q16878 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDO1Q16878 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDO1Q16878 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDO1Q16878 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDO1Q16878 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDO1Q16878 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDO1Q16878 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDO1Q16878 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDO1Q16878 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDO1Q16878 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDO1Q16878 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDO1Q16878 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDO1Q16878 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDO1Q16878 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDO1Q16878 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDO1Q16878 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDO1Q16878 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDO1Q16878 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDO1Q16878 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDO1Q16878 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDO1Q16878 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDO1Q16878 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDO1Q16878 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDO1Q16878 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDO1Q16878 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDO1Q16878 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDO1Q16878 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDO1Q16878 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms