Protein–RNA interactions for Protein: Q16570

ACKR1, Atypical chemokine receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACKR1Q16570 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACKR1Q16570 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACKR1Q16570 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ACKR1Q16570 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ACKR1Q16570 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ACKR1Q16570 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
ACKR1Q16570 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ACKR1Q16570 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ACKR1Q16570 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ACKR1Q16570 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ACKR1Q16570 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ACKR1Q16570 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ACKR1Q16570 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ACKR1Q16570 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
ACKR1Q16570 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ACKR1Q16570 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ACKR1Q16570 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
ACKR1Q16570 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ACKR1Q16570 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ACKR1Q16570 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ACKR1Q16570 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ACKR1Q16570 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ACKR1Q16570 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
ACKR1Q16570 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ACKR1Q16570 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ACKR1Q16570 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ACKR1Q16570 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ACKR1Q16570 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ACKR1Q16570 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ACKR1Q16570 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ACKR1Q16570 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ACKR1Q16570 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ACKR1Q16570 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ACKR1Q16570 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ACKR1Q16570 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
ACKR1Q16570 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
ACKR1Q16570 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ACKR1Q16570 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ACKR1Q16570 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ACKR1Q16570 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ACKR1Q16570 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
ACKR1Q16570 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ACKR1Q16570 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ACKR1Q16570 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACKR1Q16570 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACKR1Q16570 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACKR1Q16570 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACKR1Q16570 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACKR1Q16570 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACKR1Q16570 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACKR1Q16570 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
ACKR1Q16570 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACKR1Q16570 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACKR1Q16570 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACKR1Q16570 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACKR1Q16570 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACKR1Q16570 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
ACKR1Q16570 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ACKR1Q16570 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ACKR1Q16570 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ACKR1Q16570 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ACKR1Q16570 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ACKR1Q16570 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ACKR1Q16570 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ACKR1Q16570 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACKR1Q16570 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACKR1Q16570 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACKR1Q16570 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACKR1Q16570 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACKR1Q16570 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACKR1Q16570 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACKR1Q16570 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACKR1Q16570 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACKR1Q16570 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACKR1Q16570 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACKR1Q16570 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACKR1Q16570 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACKR1Q16570 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACKR1Q16570 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACKR1Q16570 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACKR1Q16570 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACKR1Q16570 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACKR1Q16570 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACKR1Q16570 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACKR1Q16570 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACKR1Q16570 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACKR1Q16570 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACKR1Q16570 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACKR1Q16570 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACKR1Q16570 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACKR1Q16570 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACKR1Q16570 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACKR1Q16570 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACKR1Q16570 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACKR1Q16570 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACKR1Q16570 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACKR1Q16570 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACKR1Q16570 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACKR1Q16570 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACKR1Q16570 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
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