Protein–RNA interactions for Protein: Q16549

PCSK7, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 7, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK7Q16549 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PCSK7Q16549 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PCSK7Q16549 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PCSK7Q16549 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCSK7Q16549 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCSK7Q16549 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCSK7Q16549 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PCSK7Q16549 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PCSK7Q16549 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PCSK7Q16549 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCSK7Q16549 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCSK7Q16549 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCSK7Q16549 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCSK7Q16549 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCSK7Q16549 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCSK7Q16549 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCSK7Q16549 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCSK7Q16549 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCSK7Q16549 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCSK7Q16549 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCSK7Q16549 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCSK7Q16549 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCSK7Q16549 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCSK7Q16549 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCSK7Q16549 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCSK7Q16549 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCSK7Q16549 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCSK7Q16549 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCSK7Q16549 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PCSK7Q16549 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCSK7Q16549 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCSK7Q16549 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCSK7Q16549 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCSK7Q16549 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCSK7Q16549 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCSK7Q16549 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCSK7Q16549 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCSK7Q16549 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCSK7Q16549 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCSK7Q16549 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCSK7Q16549 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCSK7Q16549 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCSK7Q16549 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCSK7Q16549 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCSK7Q16549 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCSK7Q16549 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCSK7Q16549 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCSK7Q16549 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCSK7Q16549 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCSK7Q16549 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCSK7Q16549 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCSK7Q16549 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PCSK7Q16549 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCSK7Q16549 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCSK7Q16549 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCSK7Q16549 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCSK7Q16549 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCSK7Q16549 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCSK7Q16549 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCSK7Q16549 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCSK7Q16549 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCSK7Q16549 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCSK7Q16549 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCSK7Q16549 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCSK7Q16549 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCSK7Q16549 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCSK7Q16549 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PCSK7Q16549 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCSK7Q16549 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PCSK7Q16549 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCSK7Q16549 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCSK7Q16549 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCSK7Q16549 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCSK7Q16549 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCSK7Q16549 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCSK7Q16549 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCSK7Q16549 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCSK7Q16549 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCSK7Q16549 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCSK7Q16549 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCSK7Q16549 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCSK7Q16549 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCSK7Q16549 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PCSK7Q16549 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCSK7Q16549 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCSK7Q16549 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCSK7Q16549 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCSK7Q16549 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCSK7Q16549 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCSK7Q16549 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCSK7Q16549 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCSK7Q16549 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCSK7Q16549 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCSK7Q16549 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCSK7Q16549 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCSK7Q16549 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCSK7Q16549 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCSK7Q16549 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCSK7Q16549 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCSK7Q16549 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms