Protein–RNA interactions for Protein: Q15878

CACNA1E, Voltage-dependent R-type calcium channel subunit alpha-1E, humanhuman

Predictions only

Length 2,313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1EQ15878 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CACNA1EQ15878 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CACNA1EQ15878 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CACNA1EQ15878 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CACNA1EQ15878 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CACNA1EQ15878 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CACNA1EQ15878 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CACNA1EQ15878 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CACNA1EQ15878 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CACNA1EQ15878 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CACNA1EQ15878 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CACNA1EQ15878 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CACNA1EQ15878 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CACNA1EQ15878 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CACNA1EQ15878 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CACNA1EQ15878 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CACNA1EQ15878 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CACNA1EQ15878 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CACNA1EQ15878 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CACNA1EQ15878 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CACNA1EQ15878 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CACNA1EQ15878 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CACNA1EQ15878 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CACNA1EQ15878 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CACNA1EQ15878 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CACNA1EQ15878 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CACNA1EQ15878 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CACNA1EQ15878 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CACNA1EQ15878 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CACNA1EQ15878 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CACNA1EQ15878 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CACNA1EQ15878 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CACNA1EQ15878 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CACNA1EQ15878 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CACNA1EQ15878 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CACNA1EQ15878 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CACNA1EQ15878 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CACNA1EQ15878 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CACNA1EQ15878 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CACNA1EQ15878 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CACNA1EQ15878 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CACNA1EQ15878 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CACNA1EQ15878 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CACNA1EQ15878 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CACNA1EQ15878 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CACNA1EQ15878 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CACNA1EQ15878 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CACNA1EQ15878 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CACNA1EQ15878 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CACNA1EQ15878 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CACNA1EQ15878 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CACNA1EQ15878 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CACNA1EQ15878 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CACNA1EQ15878 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CACNA1EQ15878 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CACNA1EQ15878 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CACNA1EQ15878 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CACNA1EQ15878 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CACNA1EQ15878 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CACNA1EQ15878 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CACNA1EQ15878 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CACNA1EQ15878 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CACNA1EQ15878 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CACNA1EQ15878 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CACNA1EQ15878 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CACNA1EQ15878 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CACNA1EQ15878 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CACNA1EQ15878 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CACNA1EQ15878 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CACNA1EQ15878 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CACNA1EQ15878 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CACNA1EQ15878 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CACNA1EQ15878 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CACNA1EQ15878 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CACNA1EQ15878 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CACNA1EQ15878 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CACNA1EQ15878 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CACNA1EQ15878 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CACNA1EQ15878 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CACNA1EQ15878 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CACNA1EQ15878 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CACNA1EQ15878 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CACNA1EQ15878 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CACNA1EQ15878 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CACNA1EQ15878 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CACNA1EQ15878 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CACNA1EQ15878 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CACNA1EQ15878 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CACNA1EQ15878 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CACNA1EQ15878 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CACNA1EQ15878 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CACNA1EQ15878 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CACNA1EQ15878 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CACNA1EQ15878 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CACNA1EQ15878 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CACNA1EQ15878 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CACNA1EQ15878 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CACNA1EQ15878 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CACNA1EQ15878 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CACNA1EQ15878 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms