Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SKIV2LQ15477 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SKIV2LQ15477 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SKIV2LQ15477 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SKIV2LQ15477 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SKIV2LQ15477 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SKIV2LQ15477 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SKIV2LQ15477 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SKIV2LQ15477 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SKIV2LQ15477 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SKIV2LQ15477 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SKIV2LQ15477 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SKIV2LQ15477 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SKIV2LQ15477 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SKIV2LQ15477 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SKIV2LQ15477 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SKIV2LQ15477 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SKIV2LQ15477 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SKIV2LQ15477 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SKIV2LQ15477 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SKIV2LQ15477 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SKIV2LQ15477 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SKIV2LQ15477 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SKIV2LQ15477 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SKIV2LQ15477 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SKIV2LQ15477 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SKIV2LQ15477 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SKIV2LQ15477 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SKIV2LQ15477 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SKIV2LQ15477 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SKIV2LQ15477 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SKIV2LQ15477 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SKIV2LQ15477 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SKIV2LQ15477 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SKIV2LQ15477 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SKIV2LQ15477 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SKIV2LQ15477 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SKIV2LQ15477 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SKIV2LQ15477 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SKIV2LQ15477 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SKIV2LQ15477 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SKIV2LQ15477 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SKIV2LQ15477 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SKIV2LQ15477 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SKIV2LQ15477 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SKIV2LQ15477 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SKIV2LQ15477 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SKIV2LQ15477 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SKIV2LQ15477 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SKIV2LQ15477 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SKIV2LQ15477 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SKIV2LQ15477 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SKIV2LQ15477 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SKIV2LQ15477 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SKIV2LQ15477 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SKIV2LQ15477 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SKIV2LQ15477 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SKIV2LQ15477 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SKIV2LQ15477 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SKIV2LQ15477 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SKIV2LQ15477 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SKIV2LQ15477 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SKIV2LQ15477 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SKIV2LQ15477 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SKIV2LQ15477 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SKIV2LQ15477 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
SKIV2LQ15477 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SKIV2LQ15477 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SKIV2LQ15477 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SKIV2LQ15477 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SKIV2LQ15477 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SKIV2LQ15477 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SKIV2LQ15477 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SKIV2LQ15477 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SKIV2LQ15477 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SKIV2LQ15477 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SKIV2LQ15477 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SKIV2LQ15477 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SKIV2LQ15477 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SKIV2LQ15477 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SKIV2LQ15477 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SKIV2LQ15477 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SKIV2LQ15477 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SKIV2LQ15477 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SKIV2LQ15477 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SKIV2LQ15477 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SKIV2LQ15477 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SKIV2LQ15477 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SKIV2LQ15477 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SKIV2LQ15477 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SKIV2LQ15477 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SKIV2LQ15477 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SKIV2LQ15477 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SKIV2LQ15477 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SKIV2LQ15477 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SKIV2LQ15477 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SKIV2LQ15477 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SKIV2LQ15477 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SKIV2LQ15477 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SKIV2LQ15477 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms