Protein–RNA interactions for Protein: Q15361

TTF1, Transcription termination factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 905 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF1Q15361 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TTF1Q15361 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TTF1Q15361 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TTF1Q15361 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TTF1Q15361 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
TTF1Q15361 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
TTF1Q15361 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
TTF1Q15361 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TTF1Q15361 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TTF1Q15361 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TTF1Q15361 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TTF1Q15361 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TTF1Q15361 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TTF1Q15361 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TTF1Q15361 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TTF1Q15361 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TTF1Q15361 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TTF1Q15361 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TTF1Q15361 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TTF1Q15361 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
TTF1Q15361 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TTF1Q15361 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
TTF1Q15361 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
TTF1Q15361 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TTF1Q15361 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TTF1Q15361 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TTF1Q15361 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TTF1Q15361 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TTF1Q15361 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TTF1Q15361 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TTF1Q15361 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
TTF1Q15361 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TTF1Q15361 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TTF1Q15361 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TTF1Q15361 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TTF1Q15361 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
TTF1Q15361 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
TTF1Q15361 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TTF1Q15361 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TTF1Q15361 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TTF1Q15361 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TTF1Q15361 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TTF1Q15361 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
TTF1Q15361 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TTF1Q15361 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TTF1Q15361 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TTF1Q15361 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TTF1Q15361 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TTF1Q15361 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TTF1Q15361 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TTF1Q15361 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TTF1Q15361 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TTF1Q15361 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
TTF1Q15361 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
TTF1Q15361 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TTF1Q15361 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
TTF1Q15361 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TTF1Q15361 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TTF1Q15361 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TTF1Q15361 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TTF1Q15361 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
TTF1Q15361 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TTF1Q15361 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
TTF1Q15361 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TTF1Q15361 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
TTF1Q15361 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TTF1Q15361 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TTF1Q15361 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TTF1Q15361 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TTF1Q15361 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TTF1Q15361 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
TTF1Q15361 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TTF1Q15361 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TTF1Q15361 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TTF1Q15361 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TTF1Q15361 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
TTF1Q15361 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TTF1Q15361 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TTF1Q15361 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TTF1Q15361 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TTF1Q15361 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TTF1Q15361 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TTF1Q15361 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TTF1Q15361 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TTF1Q15361 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
TTF1Q15361 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TTF1Q15361 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TTF1Q15361 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TTF1Q15361 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TTF1Q15361 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TTF1Q15361 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TTF1Q15361 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TTF1Q15361 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TTF1Q15361 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TTF1Q15361 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TTF1Q15361 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TTF1Q15361 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
TTF1Q15361 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
TTF1Q15361 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
TTF1Q15361 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
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