Protein–RNA interactions for Protein: Q15036

SNX17, Sorting nexin-17, humanhuman

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Length 470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX17Q15036 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SNX17Q15036 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SNX17Q15036 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SNX17Q15036 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SNX17Q15036 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SNX17Q15036 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SNX17Q15036 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SNX17Q15036 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SNX17Q15036 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SNX17Q15036 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SNX17Q15036 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SNX17Q15036 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SNX17Q15036 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SNX17Q15036 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
SNX17Q15036 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SNX17Q15036 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SNX17Q15036 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SNX17Q15036 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SNX17Q15036 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SNX17Q15036 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SNX17Q15036 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SNX17Q15036 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SNX17Q15036 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SNX17Q15036 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SNX17Q15036 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SNX17Q15036 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SNX17Q15036 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SNX17Q15036 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SNX17Q15036 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SNX17Q15036 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SNX17Q15036 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SNX17Q15036 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SNX17Q15036 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SNX17Q15036 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SNX17Q15036 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SNX17Q15036 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SNX17Q15036 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SNX17Q15036 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SNX17Q15036 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SNX17Q15036 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SNX17Q15036 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SNX17Q15036 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SNX17Q15036 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SNX17Q15036 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SNX17Q15036 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SNX17Q15036 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SNX17Q15036 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SNX17Q15036 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SNX17Q15036 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SNX17Q15036 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SNX17Q15036 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SNX17Q15036 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SNX17Q15036 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SNX17Q15036 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SNX17Q15036 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SNX17Q15036 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SNX17Q15036 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SNX17Q15036 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SNX17Q15036 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SNX17Q15036 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SNX17Q15036 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SNX17Q15036 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SNX17Q15036 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SNX17Q15036 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SNX17Q15036 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SNX17Q15036 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SNX17Q15036 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SNX17Q15036 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SNX17Q15036 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SNX17Q15036 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SNX17Q15036 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SNX17Q15036 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SNX17Q15036 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SNX17Q15036 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
SNX17Q15036 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SNX17Q15036 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
SNX17Q15036 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SNX17Q15036 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SNX17Q15036 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SNX17Q15036 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SNX17Q15036 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SNX17Q15036 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SNX17Q15036 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SNX17Q15036 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SNX17Q15036 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SNX17Q15036 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SNX17Q15036 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SNX17Q15036 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SNX17Q15036 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SNX17Q15036 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SNX17Q15036 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SNX17Q15036 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SNX17Q15036 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SNX17Q15036 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SNX17Q15036 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SNX17Q15036 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SNX17Q15036 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SNX17Q15036 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SNX17Q15036 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SNX17Q15036 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
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