Protein–RNA interactions for Protein: Q14978

NOLC1, Nucleolar and coiled-body phosphoprotein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 699 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOLC1Q14978 EIF4A1-229ENST00000583802 563 ntTSL 411.77□□□□□ -0.533e-6■■■□□ 16.9
NOLC1Q14978 EIF4A1-217ENST00000581384 642 ntTSL 510.95□□□□□ -0.663e-6■■■□□ 16.9
NOLC1Q14978 EIF4A1-233ENST00000584784 818 ntTSL 510.55□□□□□ -0.723e-6■■■□□ 16.9
NOLC1Q14978 EIF4A1-209ENST00000578495 916 ntTSL 510.05□□□□□ -0.83e-6■■■□□ 16.9
NOLC1Q14978 EIF4A1-237ENST00000585024 577 ntTSL 49.34□□□□□ -0.913e-6■■■□□ 16.9
NOLC1Q14978 EIF4A1-211ENST00000578754 547 ntTSL 45.96□□□□□ -1.463e-6■■■□□ 16.9
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NOLC1Q14978 SEC14L1-207ENST00000561721 637 ntTSL 215.28■□□□□ 0.044e-16■■■□□ 16.9
NOLC1Q14978 SNHG20-203ENST00000565256 1234 ntTSL 1 (best)14.45□□□□□ -0.14e-16■■■□□ 16.9
NOLC1Q14978 SNHG20-205ENST00000568363 786 ntTSL 1 (best)14.31□□□□□ -0.124e-16■■■□□ 16.9
NOLC1Q14978 SEC14L1-224ENST00000589827 1791 ntTSL 214.17□□□□□ -0.144e-16■■■□□ 16.9
NOLC1Q14978 SEC14L1-209ENST00000564509 806 ntTSL 1 (best)14.05□□□□□ -0.164e-16■■■□□ 16.9
NOLC1Q14978 SEC14L1-202ENST00000430767 5283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.184e-16■■■□□ 16.9
NOLC1Q14978 SNHG20-202ENST00000434411 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.24e-16■■■□□ 16.9
NOLC1Q14978 SEC14L1-211ENST00000569632 377 ntTSL 1 (best)12.99□□□□□ -0.334e-16■■■□□ 16.9
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NOLC1Q14978 SNHG20-201ENST00000366365 1028 ntTSL 211.4□□□□□ -0.584e-16■■■□□ 16.9
NOLC1Q14978 SCARNA16-201ENST00000515981 187 ntBASIC10.63□□□□□ -0.714e-16■■■□□ 16.9
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NOLC1Q14978 SEC14L1-210ENST00000568056 424 ntTSL 1 (best)5.31□□□□□ -1.564e-16■■■□□ 16.9
NOLC1Q14978 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.493e-6■■■□□ 16.9
NOLC1Q14978 IGSF1-201ENST00000361420 4378 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.513e-6■■■□□ 16.9
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NOLC1Q14978 IGSF1-205ENST00000370904 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.743e-6■■■□□ 16.9
NOLC1Q14978 CLNS1A-204ENST00000525428 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.29e-7■■■□□ 16.9
NOLC1Q14978 CLNS1A-201ENST00000263309 1172 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.219e-7■■■□□ 16.9
NOLC1Q14978 CLNS1A-202ENST00000525064 1121 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.349e-7■■■□□ 16.9
NOLC1Q14978 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.713e-7■■■□□ 16.9
NOLC1Q14978 SLC7A5-203ENST00000565644 3983 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.33e-7■■■□□ 16.9
NOLC1Q14978 PCK2-211ENST00000559837 756 ntTSL 318.56■□□□□ 0.561e-6■■■□□ 16.8
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NOLC1Q14978 RPL15-208ENST00000435882 1063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.117e-11■■■□□ 16.8
NOLC1Q14978 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.594e-7■■■□□ 16.8
NOLC1Q14978 SNORD116-11-201ENST00000383882 92 ntBASIC4.25□□□□□ -1.733e-14■■■□□ 16.8
NOLC1Q14978 AP1B1-208ENST00000432560 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.246e-27■■■□□ 16.8
NOLC1Q14978 AP1B1-201ENST00000317368 3903 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.216e-27■■■□□ 16.8
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NOLC1Q14978 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.932e-9■■■□□ 16.8
NOLC1Q14978 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.442e-9■■■□□ 16.8
NOLC1Q14978 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.092e-9■■■□□ 16.8
NOLC1Q14978 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.092e-9■■■□□ 16.8
NOLC1Q14978 PTPRK-204ENST00000368210 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.033e-6■■■□□ 16.8
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NOLC1Q14978 PTPRK-221ENST00000532331 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.393e-6■■■□□ 16.8
NOLC1Q14978 PTPRK-205ENST00000368213 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.543e-6■■■□□ 16.8
NOLC1Q14978 PTPRK-206ENST00000368215 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.843e-6■■■□□ 16.8
NOLC1Q14978 PTPRK-219ENST00000531050 2515 ntTSL 1 (best)9.59□□□□□ -0.873e-6■■■□□ 16.8
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NOLC1Q14978 COX6B1-201ENST00000246554 667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.292e-8■■■□□ 16.8
NOLC1Q14978 ALB-210ENST00000504043 422 ntTSL 25.93□□□□□ -1.461e-323■■■□□ 16.7
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NOLC1Q14978 MARS-227ENST00000552007 434 ntTSL 323.4■■□□□ 1.342e-15■■■□□ 16.7
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NOLC1Q14978 MARS-232ENST00000553162 575 ntTSL 221.88■■□□□ 1.092e-15■■■□□ 16.7
NOLC1Q14978 MARS-214ENST00000548714 567 ntTSL 221.5■■□□□ 1.032e-15■■■□□ 16.7
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NOLC1Q14978 MARS-223ENST00000551431 559 ntTSL 420.93■□□□□ 0.942e-15■■■□□ 16.7
NOLC1Q14978 MARS-225ENST00000551842 662 ntTSL 220.93■□□□□ 0.942e-15■■■□□ 16.7
NOLC1Q14978 MARS-208ENST00000547501 510 ntTSL 220.93■□□□□ 0.942e-15■■■□□ 16.7
NOLC1Q14978 MARS-202ENST00000447721 1328 ntTSL 220.59■□□□□ 0.892e-15■■■□□ 16.7
NOLC1Q14978 MARS-221ENST00000550449 739 ntTSL 319.87■□□□□ 0.772e-15■■■□□ 16.7
NOLC1Q14978 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.472e-15■■■□□ 16.7
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NOLC1Q14978 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.412e-15■■■□□ 16.7
NOLC1Q14978 MARS-213ENST00000548674 749 ntTSL 516.89■□□□□ 0.292e-15■■■□□ 16.7
NOLC1Q14978 MARS-203ENST00000537638 3592 ntTSL 216.47■□□□□ 0.232e-15■■■□□ 16.7
NOLC1Q14978 RPL13A-211ENST00000486930 652 ntTSL 317.01■□□□□ 0.311e-323■■■□□ 16.7
NOLC1Q14978 AL117329.1-201ENST00000423737 1815 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.665e-7■■■□□ 16.7
NOLC1Q14978 AFP-207ENST00000515675 317 ntTSL 1 (best)5.36□□□□□ -1.551e-64■■■□□ 16.7
NOLC1Q14978 AFP-205ENST00000513720 197 ntTSL 1 (best)4.59□□□□□ -1.671e-64■■■□□ 16.7
NOLC1Q14978 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.272e-8■■■□□ 16.6
NOLC1Q14978 HYOU1-220ENST00000617285 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.162e-8■■■□□ 16.6
NOLC1Q14978 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.142e-8■■■□□ 16.6
NOLC1Q14978 HYOU1-217ENST00000612687 4360 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.012e-8■■■□□ 16.6
NOLC1Q14978 LDHB-202ENST00000396075 744 ntTSL 39.22□□□□□ -0.932e-7■■■□□ 16.6
NOLC1Q14978 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.68e-7■■■□□ 16.6
NOLC1Q14978 ATIC-207ENST00000443953 2187 ntTSL 222.69■■□□□ 1.225e-8■■■□□ 16.6
NOLC1Q14978 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.195e-8■■■□□ 16.6
NOLC1Q14978 ATIC-201ENST00000236959 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.015e-8■■■□□ 16.6
NOLC1Q14978 ATIC-206ENST00000442048 442 ntTSL 38.19□□□□□ -1.15e-8■■■□□ 16.6
NOLC1Q14978 ATIC-213ENST00000479093 772 ntTSL 26.28□□□□□ -1.45e-8■■■□□ 16.6
NOLC1Q14978 ATIC-212ENST00000478734 486 ntTSL 26.1□□□□□ -1.435e-8■■■□□ 16.6
NOLC1Q14978 SNHG14-224ENST00000604135 511 nt5.32□□□□□ -1.564e-22■■■□□ 16.6
NOLC1Q14978 SNORD109A-201ENST00000459128 67 ntBASIC2.97□□□□□ -1.934e-22■■■□□ 16.6
NOLC1Q14978 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.81e-6■■■□□ 16.6
NOLC1Q14978 TOP2B-201ENST00000264331 5358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.251e-6■■■□□ 16.6
NOLC1Q14978 TOP2B-202ENST00000413971 2049 ntTSL 54.56□□□□□ -1.681e-6■■■□□ 16.6
NOLC1Q14978 TFRC-205ENST00000426789 354 ntTSL 34.07□□□□□ -1.768e-8■■■□□ 16.5
NOLC1Q14978 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.943e-8■■■□□ 16.5
NOLC1Q14978 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.723e-8■■■□□ 16.5
NOLC1Q14978 OAZ1-207ENST00000590943 1012 ntTSL 217.64■□□□□ 0.413e-8■■■□□ 16.5
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