Protein–RNA interactions for Protein: Q13829

TNFAIP1, BTB/POZ domain-containing adapter for CUL3-mediated RhoA degradation protein 2, humanhuman

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Length 316 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFAIP1Q13829 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TNFAIP1Q13829 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TNFAIP1Q13829 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TNFAIP1Q13829 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TNFAIP1Q13829 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TNFAIP1Q13829 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TNFAIP1Q13829 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TNFAIP1Q13829 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TNFAIP1Q13829 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TNFAIP1Q13829 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TNFAIP1Q13829 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TNFAIP1Q13829 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TNFAIP1Q13829 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TNFAIP1Q13829 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TNFAIP1Q13829 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TNFAIP1Q13829 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TNFAIP1Q13829 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TNFAIP1Q13829 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TNFAIP1Q13829 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TNFAIP1Q13829 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TNFAIP1Q13829 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TNFAIP1Q13829 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TNFAIP1Q13829 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TNFAIP1Q13829 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TNFAIP1Q13829 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TNFAIP1Q13829 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TNFAIP1Q13829 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TNFAIP1Q13829 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TNFAIP1Q13829 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TNFAIP1Q13829 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TNFAIP1Q13829 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TNFAIP1Q13829 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TNFAIP1Q13829 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TNFAIP1Q13829 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TNFAIP1Q13829 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TNFAIP1Q13829 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TNFAIP1Q13829 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TNFAIP1Q13829 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TNFAIP1Q13829 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TNFAIP1Q13829 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TNFAIP1Q13829 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TNFAIP1Q13829 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TNFAIP1Q13829 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TNFAIP1Q13829 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TNFAIP1Q13829 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TNFAIP1Q13829 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
TNFAIP1Q13829 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
TNFAIP1Q13829 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TNFAIP1Q13829 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TNFAIP1Q13829 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TNFAIP1Q13829 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TNFAIP1Q13829 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TNFAIP1Q13829 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TNFAIP1Q13829 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TNFAIP1Q13829 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TNFAIP1Q13829 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TNFAIP1Q13829 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TNFAIP1Q13829 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TNFAIP1Q13829 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TNFAIP1Q13829 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TNFAIP1Q13829 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TNFAIP1Q13829 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TNFAIP1Q13829 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TNFAIP1Q13829 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TNFAIP1Q13829 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TNFAIP1Q13829 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TNFAIP1Q13829 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TNFAIP1Q13829 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TNFAIP1Q13829 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TNFAIP1Q13829 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TNFAIP1Q13829 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
TNFAIP1Q13829 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TNFAIP1Q13829 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TNFAIP1Q13829 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TNFAIP1Q13829 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TNFAIP1Q13829 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TNFAIP1Q13829 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TNFAIP1Q13829 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TNFAIP1Q13829 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TNFAIP1Q13829 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
TNFAIP1Q13829 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TNFAIP1Q13829 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TNFAIP1Q13829 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TNFAIP1Q13829 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TNFAIP1Q13829 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TNFAIP1Q13829 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TNFAIP1Q13829 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TNFAIP1Q13829 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TNFAIP1Q13829 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
TNFAIP1Q13829 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TNFAIP1Q13829 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TNFAIP1Q13829 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TNFAIP1Q13829 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TNFAIP1Q13829 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TNFAIP1Q13829 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TNFAIP1Q13829 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TNFAIP1Q13829 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TNFAIP1Q13829 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TNFAIP1Q13829 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TNFAIP1Q13829 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
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