Protein–RNA interactions for Protein: Q13642

FHL1, Four and a half LIM domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHL1Q13642 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FHL1Q13642 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
FHL1Q13642 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FHL1Q13642 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FHL1Q13642 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FHL1Q13642 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FHL1Q13642 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
FHL1Q13642 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FHL1Q13642 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FHL1Q13642 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FHL1Q13642 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FHL1Q13642 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FHL1Q13642 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FHL1Q13642 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FHL1Q13642 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FHL1Q13642 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FHL1Q13642 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FHL1Q13642 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FHL1Q13642 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FHL1Q13642 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FHL1Q13642 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FHL1Q13642 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FHL1Q13642 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
FHL1Q13642 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FHL1Q13642 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FHL1Q13642 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FHL1Q13642 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FHL1Q13642 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FHL1Q13642 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FHL1Q13642 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FHL1Q13642 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FHL1Q13642 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FHL1Q13642 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FHL1Q13642 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
FHL1Q13642 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FHL1Q13642 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FHL1Q13642 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
FHL1Q13642 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FHL1Q13642 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FHL1Q13642 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FHL1Q13642 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FHL1Q13642 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FHL1Q13642 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FHL1Q13642 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FHL1Q13642 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FHL1Q13642 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FHL1Q13642 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FHL1Q13642 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FHL1Q13642 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FHL1Q13642 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FHL1Q13642 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FHL1Q13642 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FHL1Q13642 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FHL1Q13642 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
FHL1Q13642 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FHL1Q13642 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FHL1Q13642 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FHL1Q13642 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FHL1Q13642 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FHL1Q13642 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FHL1Q13642 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FHL1Q13642 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FHL1Q13642 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FHL1Q13642 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FHL1Q13642 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FHL1Q13642 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FHL1Q13642 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FHL1Q13642 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
FHL1Q13642 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FHL1Q13642 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FHL1Q13642 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FHL1Q13642 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FHL1Q13642 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FHL1Q13642 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FHL1Q13642 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FHL1Q13642 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FHL1Q13642 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FHL1Q13642 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FHL1Q13642 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FHL1Q13642 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FHL1Q13642 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FHL1Q13642 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FHL1Q13642 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FHL1Q13642 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FHL1Q13642 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FHL1Q13642 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
FHL1Q13642 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FHL1Q13642 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FHL1Q13642 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FHL1Q13642 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FHL1Q13642 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FHL1Q13642 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FHL1Q13642 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FHL1Q13642 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FHL1Q13642 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FHL1Q13642 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FHL1Q13642 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FHL1Q13642 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FHL1Q13642 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FHL1Q13642 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms