Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

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Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATRQ13535 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATRQ13535 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ATRQ13535 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATRQ13535 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ATRQ13535 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATRQ13535 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ATRQ13535 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATRQ13535 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATRQ13535 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATRQ13535 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATRQ13535 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATRQ13535 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATRQ13535 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATRQ13535 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATRQ13535 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATRQ13535 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATRQ13535 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATRQ13535 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATRQ13535 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATRQ13535 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATRQ13535 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATRQ13535 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATRQ13535 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATRQ13535 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATRQ13535 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATRQ13535 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ATRQ13535 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ATRQ13535 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ATRQ13535 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ATRQ13535 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATRQ13535 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATRQ13535 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATRQ13535 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATRQ13535 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATRQ13535 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ATRQ13535 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ATRQ13535 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATRQ13535 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATRQ13535 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATRQ13535 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ATRQ13535 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATRQ13535 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATRQ13535 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ATRQ13535 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATRQ13535 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATRQ13535 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATRQ13535 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATRQ13535 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATRQ13535 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATRQ13535 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATRQ13535 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATRQ13535 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ATRQ13535 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATRQ13535 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATRQ13535 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATRQ13535 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATRQ13535 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATRQ13535 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
ATRQ13535 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATRQ13535 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATRQ13535 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATRQ13535 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATRQ13535 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
ATRQ13535 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
ATRQ13535 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATRQ13535 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATRQ13535 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATRQ13535 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATRQ13535 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATRQ13535 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATRQ13535 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATRQ13535 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATRQ13535 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATRQ13535 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATRQ13535 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATRQ13535 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATRQ13535 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATRQ13535 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATRQ13535 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATRQ13535 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ATRQ13535 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATRQ13535 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATRQ13535 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATRQ13535 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATRQ13535 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATRQ13535 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATRQ13535 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATRQ13535 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATRQ13535 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATRQ13535 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATRQ13535 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATRQ13535 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATRQ13535 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATRQ13535 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATRQ13535 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATRQ13535 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATRQ13535 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATRQ13535 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATRQ13535 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
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