Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Length 867 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SP140Q13342 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SP140Q13342 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SP140Q13342 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SP140Q13342 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SP140Q13342 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SP140Q13342 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SP140Q13342 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SP140Q13342 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SP140Q13342 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SP140Q13342 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SP140Q13342 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SP140Q13342 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SP140Q13342 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SP140Q13342 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SP140Q13342 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SP140Q13342 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SP140Q13342 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SP140Q13342 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SP140Q13342 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SP140Q13342 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SP140Q13342 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SP140Q13342 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SP140Q13342 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SP140Q13342 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SP140Q13342 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SP140Q13342 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SP140Q13342 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SP140Q13342 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SP140Q13342 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SP140Q13342 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SP140Q13342 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SP140Q13342 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SP140Q13342 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SP140Q13342 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SP140Q13342 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SP140Q13342 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SP140Q13342 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SP140Q13342 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SP140Q13342 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SP140Q13342 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SP140Q13342 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SP140Q13342 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SP140Q13342 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
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SP140Q13342 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
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SP140Q13342 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SP140Q13342 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
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SP140Q13342 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SP140Q13342 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SP140Q13342 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
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SP140Q13342 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
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SP140Q13342 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SP140Q13342 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SP140Q13342 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SP140Q13342 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SP140Q13342 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SP140Q13342 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SP140Q13342 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SP140Q13342 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
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SP140Q13342 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SP140Q13342 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SP140Q13342 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SP140Q13342 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SP140Q13342 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SP140Q13342 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SP140Q13342 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SP140Q13342 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SP140Q13342 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SP140Q13342 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SP140Q13342 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SP140Q13342 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SP140Q13342 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SP140Q13342 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SP140Q13342 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SP140Q13342 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SP140Q13342 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SP140Q13342 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SP140Q13342 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SP140Q13342 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SP140Q13342 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SP140Q13342 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SP140Q13342 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SP140Q13342 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SP140Q13342 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SP140Q13342 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SP140Q13342 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SP140Q13342 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SP140Q13342 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
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