Protein–RNA interactions for Protein: Q13136

PPFIA1, Liprin-alpha-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA1Q13136 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PPFIA1Q13136 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PPFIA1Q13136 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PPFIA1Q13136 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PPFIA1Q13136 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PPFIA1Q13136 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PPFIA1Q13136 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PPFIA1Q13136 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PPFIA1Q13136 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PPFIA1Q13136 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PPFIA1Q13136 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PPFIA1Q13136 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PPFIA1Q13136 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PPFIA1Q13136 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PPFIA1Q13136 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PPFIA1Q13136 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PPFIA1Q13136 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PPFIA1Q13136 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PPFIA1Q13136 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PPFIA1Q13136 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PPFIA1Q13136 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PPFIA1Q13136 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PPFIA1Q13136 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PPFIA1Q13136 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PPFIA1Q13136 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PPFIA1Q13136 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PPFIA1Q13136 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PPFIA1Q13136 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PPFIA1Q13136 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PPFIA1Q13136 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PPFIA1Q13136 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PPFIA1Q13136 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PPFIA1Q13136 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
PPFIA1Q13136 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PPFIA1Q13136 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PPFIA1Q13136 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PPFIA1Q13136 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
PPFIA1Q13136 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PPFIA1Q13136 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PPFIA1Q13136 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PPFIA1Q13136 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PPFIA1Q13136 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PPFIA1Q13136 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PPFIA1Q13136 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PPFIA1Q13136 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PPFIA1Q13136 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PPFIA1Q13136 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PPFIA1Q13136 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PPFIA1Q13136 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PPFIA1Q13136 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PPFIA1Q13136 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PPFIA1Q13136 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PPFIA1Q13136 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PPFIA1Q13136 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PPFIA1Q13136 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PPFIA1Q13136 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PPFIA1Q13136 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PPFIA1Q13136 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PPFIA1Q13136 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PPFIA1Q13136 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PPFIA1Q13136 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PPFIA1Q13136 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PPFIA1Q13136 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PPFIA1Q13136 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PPFIA1Q13136 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PPFIA1Q13136 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PPFIA1Q13136 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PPFIA1Q13136 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PPFIA1Q13136 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PPFIA1Q13136 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PPFIA1Q13136 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PPFIA1Q13136 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PPFIA1Q13136 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PPFIA1Q13136 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PPFIA1Q13136 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PPFIA1Q13136 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PPFIA1Q13136 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PPFIA1Q13136 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PPFIA1Q13136 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PPFIA1Q13136 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PPFIA1Q13136 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PPFIA1Q13136 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PPFIA1Q13136 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PPFIA1Q13136 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PPFIA1Q13136 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PPFIA1Q13136 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PPFIA1Q13136 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
PPFIA1Q13136 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PPFIA1Q13136 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
PPFIA1Q13136 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PPFIA1Q13136 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PPFIA1Q13136 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
PPFIA1Q13136 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
PPFIA1Q13136 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PPFIA1Q13136 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PPFIA1Q13136 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PPFIA1Q13136 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PPFIA1Q13136 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PPFIA1Q13136 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PPFIA1Q13136 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
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