Protein–RNA interactions for Protein: Q12491

TY2B-B, Transposon Ty2-B Gag-Pol polyprotein, yeastyeast

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Length 1,770 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY2B-BQ12491 PMA1YGL008C 2757 nt5.96□□□□□ -1.46
TY2B-BQ12491 PIR3YKL163W 978 nt5.95□□□□□ -1.46
TY2B-BQ12491 YML131WYML131W 1098 nt5.95□□□□□ -1.46
TY2B-BQ12491 OPY1YBR129C 987 nt5.95□□□□□ -1.46
TY2B-BQ12491 YGR161W-CYGR161W-C 279 nt5.95□□□□□ -1.46
TY2B-BQ12491 RPL19BYBL027W 570 nt5.95□□□□□ -1.46
TY2B-BQ12491 YDR271CYDR271C 372 nt5.94□□□□□ -1.46
TY2B-BQ12491 APA2YDR530C 978 nt5.94□□□□□ -1.46
TY2B-BQ12491 YPL077CYPL077C 723 nt5.94□□□□□ -1.46
TY2B-BQ12491 SOD1YJR104C 465 nt5.93□□□□□ -1.46
TY2B-BQ12491 PEX30YLR324W 1572 nt5.93□□□□□ -1.46
TY2B-BQ12491 HXT7YDR342C 1713 nt5.93□□□□□ -1.46
TY2B-BQ12491 HXT6YDR343C 1713 nt5.93□□□□□ -1.46
TY2B-BQ12491 AIM3YBR108W 2844 nt5.93□□□□□ -1.46
TY2B-BQ12491 BNA1YJR025C 534 nt5.93□□□□□ -1.46
TY2B-BQ12491 PRD1YCL057W 2139 nt5.92□□□□□ -1.46
TY2B-BQ12491 MRP21YBL090W 534 nt5.91□□□□□ -1.46
TY2B-BQ12491 YOR008W-BYOR008W-B 102 nt5.91□□□□□ -1.46
TY2B-BQ12491 UBP9YER098W 2265 nt5.91□□□□□ -1.46
TY2B-BQ12491 CTT1YGR088W 1689 nt5.91□□□□□ -1.46
TY2B-BQ12491 MRPL7YDR237W 879 nt5.9□□□□□ -1.46
TY2B-BQ12491 PBN1YCL052C 1251 nt5.9□□□□□ -1.46
TY2B-BQ12491 PBS2YJL128C 2007 nt5.9□□□□□ -1.46
TY2B-BQ12491 GUP2YPL189W 1830 nt5.9□□□□□ -1.46
TY2B-BQ12491 ISA1YLL027W 753 nt5.9□□□□□ -1.47
TY2B-BQ12491 POF1YCL047C 777 nt5.89□□□□□ -1.47
TY2B-BQ12491 TFC7YOR110W 1308 nt5.89□□□□□ -1.47
TY2B-BQ12491 LDB19YOR322C 2457 nt5.88□□□□□ -1.47
TY2B-BQ12491 YDL121CYDL121C 450 nt5.88□□□□□ -1.47
TY2B-BQ12491 tK(CUU)CtK(CUU)C 73 nt5.88□□□□□ -1.47
TY2B-BQ12491 tK(CUU)D1tK(CUU)D1 73 nt5.88□□□□□ -1.47
TY2B-BQ12491 tK(CUU)D2tK(CUU)D2 73 nt5.88□□□□□ -1.47
TY2B-BQ12491 tK(CUU)E1tK(CUU)E1 73 nt5.88□□□□□ -1.47
TY2B-BQ12491 tK(CUU)E2tK(CUU)E2 73 nt5.88□□□□□ -1.47
TY2B-BQ12491 tK(CUU)FtK(CUU)F 73 nt5.88□□□□□ -1.47
TY2B-BQ12491 tK(CUU)G1tK(CUU)G1 73 nt5.88□□□□□ -1.47
TY2B-BQ12491 tK(CUU)G2tK(CUU)G2 73 nt5.88□□□□□ -1.47
TY2B-BQ12491 tK(CUU)G3tK(CUU)G3 73 nt5.88□□□□□ -1.47
TY2B-BQ12491 tK(CUU)ItK(CUU)I 73 nt5.88□□□□□ -1.47
TY2B-BQ12491 tK(CUU)JtK(CUU)J 73 nt5.88□□□□□ -1.47
TY2B-BQ12491 tK(CUU)KtK(CUU)K 73 nt5.88□□□□□ -1.47
TY2B-BQ12491 tK(CUU)MtK(CUU)M 73 nt5.88□□□□□ -1.47
TY2B-BQ12491 tK(CUU)PtK(CUU)P 73 nt5.88□□□□□ -1.47
TY2B-BQ12491 YLR049CYLR049C 1287 nt5.88□□□□□ -1.47
TY2B-BQ12491 URA4YLR420W 1095 nt5.88□□□□□ -1.47
TY2B-BQ12491 YIM1YMR152W 1098 nt5.88□□□□□ -1.47
TY2B-BQ12491 NRK1YNL129W 723 nt5.88□□□□□ -1.47
TY2B-BQ12491 ARC40YBR234C 1155 nt5.88□□□□□ -1.47
TY2B-BQ12491 GDE1YPL110C 3672 nt5.88□□□□□ -1.47
TY2B-BQ12491 TSL1YML100W 3297 nt5.88□□□□□ -1.47
TY2B-BQ12491 GAS3YMR215W 1575 nt5.88□□□□□ -1.47
TY2B-BQ12491 SKG6YHR149C 2205 nt5.88□□□□□ -1.47
TY2B-BQ12491 AAD10YJR155W 867 nt5.88□□□□□ -1.47
TY2B-BQ12491 YGR018CYGR018C 330 nt5.87□□□□□ -1.47
TY2B-BQ12491 GPP1YIL053W 753 nt5.87□□□□□ -1.47
TY2B-BQ12491 TDA8YAL064C-A 381 nt5.87□□□□□ -1.47
TY2B-BQ12491 COX19YLL018C-A 297 nt5.87□□□□□ -1.47
TY2B-BQ12491 NUP1YOR098C 3231 nt5.87□□□□□ -1.47
TY2B-BQ12491 NOG1YPL093W 1944 nt5.87□□□□□ -1.47
TY2B-BQ12491 FRE3YOR381W 2136 nt5.87□□□□□ -1.47
TY2B-BQ12491 YNR061CYNR061C 660 nt5.86□□□□□ -1.47
TY2B-BQ12491 POP4YBR257W 840 nt5.86□□□□□ -1.47
TY2B-BQ12491 ALG9YNL219C 1668 nt5.85□□□□□ -1.47
TY2B-BQ12491 VID22YLR373C 2706 nt5.85□□□□□ -1.47
TY2B-BQ12491 YDR056CYDR056C 618 nt5.85□□□□□ -1.47
TY2B-BQ12491 MRT4YKL009W 711 nt5.85□□□□□ -1.47
TY2B-BQ12491 JLP1YLL057C 1239 nt5.85□□□□□ -1.47
TY2B-BQ12491 EMP47YFL048C 1338 nt5.84□□□□□ -1.47
TY2B-BQ12491 CMK1YFR014C 1341 nt5.84□□□□□ -1.47
TY2B-BQ12491 TRM8YDL201W 861 nt5.84□□□□□ -1.47
TY2B-BQ12491 RMR1YGL250W 726 nt5.84□□□□□ -1.47
TY2B-BQ12491 AIR1YIL079C 1083 nt5.84□□□□□ -1.47
TY2B-BQ12491 ADE6YGR061C 4077 nt5.83□□□□□ -1.48
TY2B-BQ12491 JIP5YPR169W 1479 nt5.83□□□□□ -1.48
TY2B-BQ12491 RMD1YDL001W 1293 nt5.83□□□□□ -1.48
TY2B-BQ12491 HOYDL227C 1761 nt5.81□□□□□ -1.48
TY2B-BQ12491 SOL4YGR248W 768 nt5.81□□□□□ -1.48
TY2B-BQ12491 COQ5YML110C 924 nt5.81□□□□□ -1.48
TY2B-BQ12491 MRP51YPL118W 1035 nt5.81□□□□□ -1.48
TY2B-BQ12491 COX11YPL132W 903 nt5.81□□□□□ -1.48
TY2B-BQ12491 CST6YIL036W 1764 nt5.81□□□□□ -1.48
TY2B-BQ12491 CHK1YBR274W 1584 nt5.81□□□□□ -1.48
TY2B-BQ12491 ROG3YFR022W 2202 nt5.81□□□□□ -1.48
TY2B-BQ12491 RAD2YGR258C 3096 nt5.81□□□□□ -1.48
TY2B-BQ12491 HST1YOL068C 1512 nt5.81□□□□□ -1.48
TY2B-BQ12491 RPG1YBR079C 2895 nt5.8□□□□□ -1.48
TY2B-BQ12491 TEL2YGR099W 2067 nt5.8□□□□□ -1.48
TY2B-BQ12491 OAR1YKL055C 837 nt5.8□□□□□ -1.48
TY2B-BQ12491 LCB2YDR062W 1686 nt5.8□□□□□ -1.48
TY2B-BQ12491 YBR056W-AYBR056W-A 201 nt5.8□□□□□ -1.48
TY2B-BQ12491 EFM2YBR271W 1260 nt5.8□□□□□ -1.48
TY2B-BQ12491 MSB2YGR014W 3921 nt5.79□□□□□ -1.48
TY2B-BQ12491 FUN30YAL019W 3396 nt5.79□□□□□ -1.48
TY2B-BQ12491 YEL045CYEL045C 426 nt5.79□□□□□ -1.48
TY2B-BQ12491 YEL074WYEL074W 339 nt5.79□□□□□ -1.48
TY2B-BQ12491 YBL036CYBL036C 774 nt5.79□□□□□ -1.48
TY2B-BQ12491 NOC4YPR144C 1659 nt5.78□□□□□ -1.48
TY2B-BQ12491 TPA1YER049W 1935 nt5.78□□□□□ -1.48
TY2B-BQ12491 LCB5YLR260W 2064 nt5.78□□□□□ -1.48
TY2B-BQ12491 TGL4YKR089C 2733 nt5.78□□□□□ -1.48
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