Protein–RNA interactions for Protein: Q12405

LPX1, Peroxisomal membrane protein LPX1, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
LPX1Q12405 YGR226CYGR226C 210 nt5.69□□□□□ -1.5
LPX1Q12405 SDS3YIL084C 984 nt5.69□□□□□ -1.5
LPX1Q12405 GAT4YIR013C 366 nt5.69□□□□□ -1.5
LPX1Q12405 RFC2YJR068W 1062 nt5.69□□□□□ -1.5
LPX1Q12405 EMG1YLR186W 759 nt5.69□□□□□ -1.5
LPX1Q12405 CIN2YPL241C 807 nt5.69□□□□□ -1.5
LPX1Q12405 YPL261CYPL261C 309 nt5.69□□□□□ -1.5
LPX1Q12405 YBR287WYBR287W 1284 nt5.69□□□□□ -1.5
LPX1Q12405 RRP7YCL031C 894 nt5.69□□□□□ -1.5
LPX1Q12405 tN(GUU)CtN(GUU)C 74 nt5.68□□□□□ -1.5
LPX1Q12405 tN(GUU)FtN(GUU)F 74 nt5.68□□□□□ -1.5
LPX1Q12405 tN(GUU)GtN(GUU)G 74 nt5.68□□□□□ -1.5
LPX1Q12405 tN(GUU)KtN(GUU)K 74 nt5.68□□□□□ -1.5
LPX1Q12405 tN(GUU)LtN(GUU)L 74 nt5.68□□□□□ -1.5
LPX1Q12405 tN(GUU)N1tN(GUU)N1 74 nt5.68□□□□□ -1.5
LPX1Q12405 tN(GUU)N2tN(GUU)N2 74 nt5.68□□□□□ -1.5
LPX1Q12405 tN(GUU)O1tN(GUU)O1 74 nt5.68□□□□□ -1.5
LPX1Q12405 tN(GUU)O2tN(GUU)O2 74 nt5.68□□□□□ -1.5
LPX1Q12405 tN(GUU)PtN(GUU)P 74 nt5.68□□□□□ -1.5
LPX1Q12405 RSR1YGR152C 819 nt5.68□□□□□ -1.5
LPX1Q12405 YIL077CYIL077C 963 nt5.68□□□□□ -1.5
LPX1Q12405 TEF4YKL081W 1239 nt5.68□□□□□ -1.5
LPX1Q12405 MTD1YKR080W 963 nt5.68□□□□□ -1.5
LPX1Q12405 TFS1YLR178C 660 nt5.68□□□□□ -1.5
LPX1Q12405 SNO1YMR095C 675 nt5.68□□□□□ -1.5
LPX1Q12405 SAS2YMR127C 1017 nt5.68□□□□□ -1.5
LPX1Q12405 YOR008W-BYOR008W-B 102 nt5.68□□□□□ -1.5
LPX1Q12405 MUM2YBR057C 1101 nt5.68□□□□□ -1.5
LPX1Q12405 YBR071WYBR071W 636 nt5.68□□□□□ -1.5
LPX1Q12405 BSD2YBR290W 966 nt5.68□□□□□ -1.5
LPX1Q12405 COM2YER130C 1332 nt5.68□□□□□ -1.5
LPX1Q12405 SPS2YDR522C 1509 nt5.68□□□□□ -1.5
LPX1Q12405 YIL001WYIL001W 1542 nt5.68□□□□□ -1.5
LPX1Q12405 TAF8YML114C 1533 nt5.68□□□□□ -1.5
LPX1Q12405 RMD9YGL107C 1941 nt5.68□□□□□ -1.5
LPX1Q12405 NUD1YOR373W 2556 nt5.67□□□□□ -1.5
LPX1Q12405 TIM54YJL054W 1437 nt5.67□□□□□ -1.5
LPX1Q12405 PYC1YGL062W 3537 nt5.67□□□□□ -1.5
LPX1Q12405 YDL057WYDL057W 987 nt5.67□□□□□ -1.5
LPX1Q12405 YGR111WYGR111W 1203 nt5.67□□□□□ -1.5
LPX1Q12405 YGR219WYGR219W 342 nt5.67□□□□□ -1.5
LPX1Q12405 YHL009W-AYHL009W-A 1242 nt5.67□□□□□ -1.5
LPX1Q12405 CAB2YIL083C 1098 nt5.67□□□□□ -1.5
LPX1Q12405 COS9YKL219W 1224 nt5.67□□□□□ -1.5
LPX1Q12405 SEC13YLR208W 894 nt5.67□□□□□ -1.5
LPX1Q12405 SEC14YMR079W 915 nt5.67□□□□□ -1.5
LPX1Q12405 ECM13YBL043W 774 nt5.67□□□□□ -1.5
LPX1Q12405 VMA4YOR332W 702 nt5.67□□□□□ -1.5
LPX1Q12405 YOR338WYOR338W 1092 nt5.67□□□□□ -1.5
LPX1Q12405 FIG1YBR040W 897 nt5.67□□□□□ -1.5
LPX1Q12405 YMR155WYMR155W 1644 nt5.66□□□□□ -1.5
LPX1Q12405 PHO12YHR215W 1404 nt5.66□□□□□ -1.5
LPX1Q12405 PHO11YAR071W 1404 nt5.66□□□□□ -1.5
LPX1Q12405 ADE13YLR359W 1449 nt5.66□□□□□ -1.5
LPX1Q12405 WTM2YOR229W 1404 nt5.66□□□□□ -1.5
LPX1Q12405 FUM1YPL262W 1467 nt5.66□□□□□ -1.5
LPX1Q12405 YDL034WYDL034W 345 nt5.66□□□□□ -1.5
LPX1Q12405 OCA6YDR067C 675 nt5.66□□□□□ -1.5
LPX1Q12405 CAD1YDR423C 1230 nt5.66□□□□□ -1.5
LPX1Q12405 EMC4YGL231C 573 nt5.66□□□□□ -1.5
LPX1Q12405 LDB18YLL049W 540 nt5.66□□□□□ -1.5
LPX1Q12405 MID2YLR332W 1131 nt5.66□□□□□ -1.5
LPX1Q12405 YLR334CYLR334C 381 nt5.66□□□□□ -1.5
LPX1Q12405 PML39YML107C 1005 nt5.66□□□□□ -1.5
LPX1Q12405 YNL277W-AYNL277W-A 189 nt5.66□□□□□ -1.5
LPX1Q12405 YNR061CYNR061C 660 nt5.66□□□□□ -1.5
LPX1Q12405 YOL097W-AYOL097W-A 186 nt5.66□□□□□ -1.5
LPX1Q12405 SER1YOR184W 1188 nt5.66□□□□□ -1.5
LPX1Q12405 MPD1YOR288C 957 nt5.66□□□□□ -1.5
LPX1Q12405 YPR015CYPR015C 744 nt5.66□□□□□ -1.5
LPX1Q12405 MRP2YPR166C 348 nt5.66□□□□□ -1.5
LPX1Q12405 ERT1YBR239C 1590 nt5.66□□□□□ -1.5
LPX1Q12405 BUL1YMR275C 2931 nt5.65□□□□□ -1.5
LPX1Q12405 ART10YLR392C 1557 nt5.65□□□□□ -1.5
LPX1Q12405 YDL186WYDL186W 834 nt5.65□□□□□ -1.5
LPX1Q12405 TLG1YDR468C 675 nt5.65□□□□□ -1.5
LPX1Q12405 YER134CYER134C 537 nt5.65□□□□□ -1.5
LPX1Q12405 YGR115CYGR115C 780 nt5.65□□□□□ -1.5
LPX1Q12405 HTD2YHR067W 843 nt5.65□□□□□ -1.5
LPX1Q12405 PEX18YHR160C 852 nt5.65□□□□□ -1.5
LPX1Q12405 YIL082WYIL082W 873 nt5.65□□□□□ -1.5
LPX1Q12405 SFH5YJL145W 885 nt5.65□□□□□ -1.5
LPX1Q12405 YJL218WYJL218W 591 nt5.65□□□□□ -1.5
LPX1Q12405 YJR071WYJR071W 369 nt5.65□□□□□ -1.5
LPX1Q12405 YLR124WYLR124W 345 nt5.65□□□□□ -1.5
LPX1Q12405 PGA3YML125C 939 nt5.65□□□□□ -1.5
LPX1Q12405 YMR085WYMR085W 1299 nt5.65□□□□□ -1.5
LPX1Q12405 YIM1YMR152W 1098 nt5.65□□□□□ -1.5
LPX1Q12405 IAH1YOR126C 717 nt5.65□□□□□ -1.5
LPX1Q12405 HUT1YPL244C 1020 nt5.65□□□□□ -1.5
LPX1Q12405 REF2YDR195W 1602 nt5.65□□□□□ -1.51
LPX1Q12405 PST1YDR055W 1335 nt5.65□□□□□ -1.51
LPX1Q12405 SUP45YBR143C 1314 nt5.65□□□□□ -1.51
LPX1Q12405 SLD2YKL108W 1362 nt5.65□□□□□ -1.51
LPX1Q12405 ESC8YOL017W 2145 nt5.65□□□□□ -1.51
LPX1Q12405 YMR027WYMR027W 1413 nt5.65□□□□□ -1.51
LPX1Q12405 YEL020CYEL020C 1683 nt5.64□□□□□ -1.51
LPX1Q12405 NSE5YML023C 1671 nt5.64□□□□□ -1.51
LPX1Q12405 YFL041W-AYFL041W-A 192 nt5.64□□□□□ -1.51
LPX1Q12405 APQ13YJL075C 417 nt5.64□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 15.6 ms