Protein–RNA interactions for Protein: Q04511

UFO1, Ubiquitin ligase complex F-box protein UFO1, yeastyeast

Predictions only

Length 668 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
UFO1Q04511 YHR214WYHR214W 612 nt5.16□□□□□ -1.58
UFO1Q04511 DID4YKL002W 699 nt5.16□□□□□ -1.58
UFO1Q04511 YAR066WYAR066W 612 nt5.16□□□□□ -1.58
UFO1Q04511 CSI1YMR025W 888 nt5.16□□□□□ -1.58
UFO1Q04511 YPL191CYPL191C 1083 nt5.16□□□□□ -1.58
UFO1Q04511 MSH1YHR120W 2880 nt5.16□□□□□ -1.58
UFO1Q04511 ASK10YGR097W 3441 nt5.15□□□□□ -1.58
UFO1Q04511 RPC53YDL150W 1269 nt5.15□□□□□ -1.59
UFO1Q04511 YDR417CYDR417C 372 nt5.15□□□□□ -1.59
UFO1Q04511 YGL185CYGL185C 1140 nt5.15□□□□□ -1.59
UFO1Q04511 GRE3YHR104W 984 nt5.15□□□□□ -1.59
UFO1Q04511 YLR365WYLR365W 333 nt5.15□□□□□ -1.59
UFO1Q04511 MDG1YNL173C 1101 nt5.15□□□□□ -1.59
UFO1Q04511 YBR292CYBR292C 372 nt5.15□□□□□ -1.59
UFO1Q04511 PRD1YCL057W 2139 nt5.15□□□□□ -1.59
UFO1Q04511 CLA4YNL298W 2529 nt5.15□□□□□ -1.59
UFO1Q04511 MTC1YJL123C 1437 nt5.14□□□□□ -1.59
UFO1Q04511 PEX19YDL065C 1029 nt5.14□□□□□ -1.59
UFO1Q04511 ARG3YJL088W 1017 nt5.14□□□□□ -1.59
UFO1Q04511 GMH1YKR030W 822 nt5.14□□□□□ -1.59
UFO1Q04511 YMR086C-AYMR086C-A 339 nt5.14□□□□□ -1.59
UFO1Q04511 ATG16YMR159C 453 nt5.14□□□□□ -1.59
UFO1Q04511 TLG2YOL018C 1194 nt5.14□□□□□ -1.59
UFO1Q04511 NRG2YBR066C 663 nt5.14□□□□□ -1.59
UFO1Q04511 SEC9YGR009C 1956 nt5.14□□□□□ -1.59
UFO1Q04511 FAA4YMR246W 2085 nt5.14□□□□□ -1.59
UFO1Q04511 UGA2YBR006W 1494 nt5.13□□□□□ -1.59
UFO1Q04511 PRP19YLL036C 1512 nt5.13□□□□□ -1.59
UFO1Q04511 YDL183CYDL183C 963 nt5.13□□□□□ -1.59
UFO1Q04511 ASP1YDR321W 1146 nt5.13□□□□□ -1.59
UFO1Q04511 MF(ALPHA)2YGL089C 363 nt5.13□□□□□ -1.59
UFO1Q04511 YGL218WYGL218W 651 nt5.13□□□□□ -1.59
UFO1Q04511 TIM21YGR033C 720 nt5.13□□□□□ -1.59
UFO1Q04511 TRX2YGR209C 315 nt5.13□□□□□ -1.59
UFO1Q04511 YJL047C-AYJL047C-A 135 nt5.13□□□□□ -1.59
UFO1Q04511 SPC3YLR066W 555 nt5.13□□□□□ -1.59
UFO1Q04511 PRE7YBL041W 726 nt5.13□□□□□ -1.59
UFO1Q04511 MDY2YOL111C 639 nt5.13□□□□□ -1.59
UFO1Q04511 ZPS1YOL154W 750 nt5.13□□□□□ -1.59
UFO1Q04511 APM2YHL019C 1818 nt5.13□□□□□ -1.59
UFO1Q04511 MMT2YPL224C 1455 nt5.13□□□□□ -1.59
UFO1Q04511 TEC1YBR083W 1461 nt5.13□□□□□ -1.59
UFO1Q04511 IPK1YDR315C 846 nt5.12□□□□□ -1.59
UFO1Q04511 GRX4YER174C 735 nt5.12□□□□□ -1.59
UFO1Q04511 YHB1YGR234W 1200 nt5.12□□□□□ -1.59
UFO1Q04511 tX(XXX)DtX(XXX)D 100 nt5.12□□□□□ -1.59
UFO1Q04511 EMG1YLR186W 759 nt5.12□□□□□ -1.59
UFO1Q04511 YML094C-AYML094C-A 402 nt5.12□□□□□ -1.59
UFO1Q04511 YOR008W-BYOR008W-B 102 nt5.12□□□□□ -1.59
UFO1Q04511 YOR062CYOR062C 807 nt5.12□□□□□ -1.59
UFO1Q04511 HAT1YPL001W 1125 nt5.12□□□□□ -1.59
UFO1Q04511 TOM5YPR133W-A 153 nt5.12□□□□□ -1.59
UFO1Q04511 UBA2YDR390C 1911 nt5.12□□□□□ -1.59
UFO1Q04511 UBX7YBR273C 1311 nt5.12□□□□□ -1.59
UFO1Q04511 WTM2YOR229W 1404 nt5.12□□□□□ -1.59
UFO1Q04511 VID30YGL227W 2877 nt5.12□□□□□ -1.59
UFO1Q04511 STE7YDL159W 1548 nt5.12□□□□□ -1.59
UFO1Q04511 APE1YKL103C 1545 nt5.12□□□□□ -1.59
UFO1Q04511 FZO1YBR179C 2568 nt5.11□□□□□ -1.59
UFO1Q04511 PRT1YOR361C 2292 nt5.11□□□□□ -1.59
UFO1Q04511 CKB2YOR039W 777 nt5.11□□□□□ -1.59
UFO1Q04511 CUE5YOR042W 1236 nt5.11□□□□□ -1.59
UFO1Q04511 YLR345WYLR345W 1530 nt5.11□□□□□ -1.59
UFO1Q04511 NUP42YDR192C 1293 nt5.1□□□□□ -1.59
UFO1Q04511 GIC2YDR309C 1152 nt5.1□□□□□ -1.59
UFO1Q04511 RPL12AYEL054C 498 nt5.1□□□□□ -1.59
UFO1Q04511 PUS6YGR169C 1215 nt5.1□□□□□ -1.59
UFO1Q04511 Q0255Q0255 1419 nt5.1□□□□□ -1.59
UFO1Q04511 VHS2YIL135C 1311 nt5.1□□□□□ -1.59
UFO1Q04511 IXR1YKL032C 1794 nt5.1□□□□□ -1.59
UFO1Q04511 YLR374CYLR374C 390 nt5.1□□□□□ -1.59
UFO1Q04511 HEK2YBL032W 1146 nt5.1□□□□□ -1.59
UFO1Q04511 TRS33YOR115C 807 nt5.1□□□□□ -1.59
UFO1Q04511 MCM4YPR019W 2802 nt5.1□□□□□ -1.59
UFO1Q04511 GIP1YBR045C 1920 nt5.09□□□□□ -1.59
UFO1Q04511 ARN1YHL040C 1884 nt5.09□□□□□ -1.59
UFO1Q04511 AIM10YER087W 1731 nt5.09□□□□□ -1.59
UFO1Q04511 PAL1YDR348C 1500 nt5.09□□□□□ -1.59
UFO1Q04511 GPR1YDL035C 2886 nt5.09□□□□□ -1.59
UFO1Q04511 AIM6YDL237W 1173 nt5.09□□□□□ -1.59
UFO1Q04511 DOS2YDR068W 933 nt5.09□□□□□ -1.59
UFO1Q04511 YFL041W-AYFL041W-A 192 nt5.09□□□□□ -1.59
UFO1Q04511 YJR085CYJR085C 318 nt5.09□□□□□ -1.59
UFO1Q04511 YAL044W-AYAL044W-A 333 nt5.09□□□□□ -1.59
UFO1Q04511 ECM9YKR004C 1134 nt5.09□□□□□ -1.59
UFO1Q04511 YLR307C-AYLR307C-A 264 nt5.09□□□□□ -1.59
UFO1Q04511 CSR1YLR380W 1227 nt5.09□□□□□ -1.59
UFO1Q04511 TEX1YNL253W 1269 nt5.09□□□□□ -1.59
UFO1Q04511 YNR042WYNR042W 429 nt5.09□□□□□ -1.59
UFO1Q04511 ECM8YBR076W 1065 nt5.09□□□□□ -1.59
UFO1Q04511 snR19snR19 568 nt5.09□□□□□ -1.59
UFO1Q04511 GCN20YFR009W 2259 nt5.09□□□□□ -1.59
UFO1Q04511 BUD22YMR014W 1560 nt5.08□□□□□ -1.6
UFO1Q04511 PAD1YDR538W 729 nt5.08□□□□□ -1.6
UFO1Q04511 KEG1YFR042W 603 nt5.08□□□□□ -1.6
UFO1Q04511 ERG25YGR060W 930 nt5.08□□□□□ -1.6
UFO1Q04511 SFH5YJL145W 885 nt5.08□□□□□ -1.6
UFO1Q04511 RSM26YJR101W 801 nt5.08□□□□□ -1.6
UFO1Q04511 YKR047WYKR047W 306 nt5.08□□□□□ -1.6
UFO1Q04511 NIT3YLR351C 876 nt5.08□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 18.5 ms