Protein–RNA interactions for Protein: Q04007

SND1, SRP-independent targeting protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 877 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SND1Q04007 IMP3YHR148W 552 nt5.35□□□□□ -1.55
SND1Q04007 PHO86YJL117W 936 nt5.35□□□□□ -1.55
SND1Q04007 YJR085CYJR085C 318 nt5.35□□□□□ -1.55
SND1Q04007 PRP45YAL032C 1140 nt5.35□□□□□ -1.55
SND1Q04007 TTI2YJR136C 1266 nt5.35□□□□□ -1.55
SND1Q04007 SED5YLR026C 1023 nt5.35□□□□□ -1.55
SND1Q04007 ERD2YBL040C 660 nt5.35□□□□□ -1.55
SND1Q04007 YOR024WYOR024W 324 nt5.35□□□□□ -1.55
SND1Q04007 SCO1YBR037C 888 nt5.35□□□□□ -1.55
SND1Q04007 DCC1YCL016C 1143 nt5.35□□□□□ -1.55
SND1Q04007 ATG20YDL113C 1923 nt5.35□□□□□ -1.55
SND1Q04007 NRD1YNL251C 1728 nt5.34□□□□□ -1.55
SND1Q04007 MDM38YOL027C 1722 nt5.34□□□□□ -1.55
SND1Q04007 SUL2YLR092W 2682 nt5.34□□□□□ -1.55
SND1Q04007 FZO1YBR179C 2568 nt5.34□□□□□ -1.55
SND1Q04007 ALG2YGL065C 1512 nt5.34□□□□□ -1.55
SND1Q04007 ROG3YFR022W 2202 nt5.34□□□□□ -1.55
SND1Q04007 YER067C-AYER067C-A 324 nt5.34□□□□□ -1.55
SND1Q04007 YHR069C-AYHR069C-A 363 nt5.34□□□□□ -1.55
SND1Q04007 YJR056CYJR056C 711 nt5.34□□□□□ -1.55
SND1Q04007 PSY3YLR376C 729 nt5.34□□□□□ -1.55
SND1Q04007 RPA49YNL248C 1248 nt5.34□□□□□ -1.55
SND1Q04007 GRX1YCL035C 333 nt5.34□□□□□ -1.55
SND1Q04007 NDC1YML031W 1968 nt5.34□□□□□ -1.55
SND1Q04007 HUL4YJR036C 2679 nt5.34□□□□□ -1.55
SND1Q04007 LEU1YGL009C 2340 nt5.34□□□□□ -1.56
SND1Q04007 ALG11YNL048W 1647 nt5.34□□□□□ -1.56
SND1Q04007 YDR290WYDR290W 330 nt5.33□□□□□ -1.56
SND1Q04007 YFT2YDR319C 825 nt5.33□□□□□ -1.56
SND1Q04007 UTR4YEL038W 684 nt5.33□□□□□ -1.56
SND1Q04007 PEX21YGR239C 867 nt5.33□□□□□ -1.56
SND1Q04007 YJL193WYJL193W 1209 nt5.33□□□□□ -1.56
SND1Q04007 DID4YKL002W 699 nt5.33□□□□□ -1.56
SND1Q04007 JLP1YLL057C 1239 nt5.33□□□□□ -1.56
SND1Q04007 YOR034C-AYOR034C-A 243 nt5.33□□□□□ -1.56
SND1Q04007 GAL10YBR019C 2100 nt5.33□□□□□ -1.56
SND1Q04007 BIT2YBR270C 1638 nt5.33□□□□□ -1.56
SND1Q04007 AVT3YKL146W 2079 nt5.33□□□□□ -1.56
SND1Q04007 SYP1YCR030C 2613 nt5.32□□□□□ -1.56
SND1Q04007 AIM6YDL237W 1173 nt5.32□□□□□ -1.56
SND1Q04007 YDR161WYDR161W 1164 nt5.32□□□□□ -1.56
SND1Q04007 GRX4YER174C 735 nt5.32□□□□□ -1.56
SND1Q04007 OKP1YGR179C 1221 nt5.32□□□□□ -1.56
SND1Q04007 TEF4YKL081W 1239 nt5.32□□□□□ -1.56
SND1Q04007 LDB18YLL049W 540 nt5.32□□□□□ -1.56
SND1Q04007 TGS1YPL157W 948 nt5.32□□□□□ -1.56
SND1Q04007 HSP26YBR072W 645 nt5.32□□□□□ -1.56
SND1Q04007 MRPL37YBR268W 318 nt5.32□□□□□ -1.56
SND1Q04007 CDC9YDL164C 2268 nt5.32□□□□□ -1.56
SND1Q04007 SSA2YLL024C 1920 nt5.32□□□□□ -1.56
SND1Q04007 FUM1YPL262W 1467 nt5.32□□□□□ -1.56
SND1Q04007 HSP82YPL240C 2130 nt5.32□□□□□ -1.56
SND1Q04007 MCX1YBR227C 1563 nt5.31□□□□□ -1.56
SND1Q04007 PSE1YMR308C 3270 nt5.31□□□□□ -1.56
SND1Q04007 ACT1YFL039C 1128 nt5.31□□□□□ -1.56
SND1Q04007 DAM1YGR113W 1032 nt5.31□□□□□ -1.56
SND1Q04007 RPL21BYPL079W 483 nt5.31□□□□□ -1.56
SND1Q04007 IMA1YGR287C 1770 nt5.31□□□□□ -1.56
SND1Q04007 IKS1YJL057C 2004 nt5.31□□□□□ -1.56
SND1Q04007 SEC9YGR009C 1956 nt5.31□□□□□ -1.56
SND1Q04007 RTK1YDL025C 1863 nt5.3□□□□□ -1.56
SND1Q04007 ENT1YDL161W 1365 nt5.3□□□□□ -1.56
SND1Q04007 SRO9YCL037C 1305 nt5.3□□□□□ -1.56
SND1Q04007 ATE1YGL017W 1512 nt5.3□□□□□ -1.56
SND1Q04007 GON7YJL184W 372 nt5.3□□□□□ -1.56
SND1Q04007 CYC1YJR048W 330 nt5.3□□□□□ -1.56
SND1Q04007 YKL177WYKL177W 339 nt5.3□□□□□ -1.56
SND1Q04007 MED7YOL135C 669 nt5.3□□□□□ -1.56
SND1Q04007 CNS1YBR155W 1158 nt5.3□□□□□ -1.56
SND1Q04007 APJ1YNL077W 1587 nt5.29□□□□□ -1.56
SND1Q04007 PUF2YPR042C 3228 nt5.29□□□□□ -1.56
SND1Q04007 BRE2YLR015W 1518 nt5.29□□□□□ -1.56
SND1Q04007 YNL095CYNL095C 1929 nt5.29□□□□□ -1.56
SND1Q04007 GLT1YDL171C 6438 nt5.29□□□□□ -1.56
SND1Q04007 MIH1YMR036C 1665 nt5.29□□□□□ -1.56
SND1Q04007 SDT1YGL224C 843 nt5.29□□□□□ -1.56
SND1Q04007 WSS1YHR134W 810 nt5.29□□□□□ -1.56
SND1Q04007 PCL1YNL289W 840 nt5.29□□□□□ -1.56
SND1Q04007 SSO1YPL232W 873 nt5.29□□□□□ -1.56
SND1Q04007 SHE3YBR130C 1278 nt5.29□□□□□ -1.56
SND1Q04007 EFM2YBR271W 1260 nt5.29□□□□□ -1.56
SND1Q04007 HIR2YOR038C 2628 nt5.29□□□□□ -1.56
SND1Q04007 TFA1YKL028W 1449 nt5.29□□□□□ -1.56
SND1Q04007 GDB1YPR184W 4611 nt5.29□□□□□ -1.56
SND1Q04007 CTS1YLR286C 1689 nt5.28□□□□□ -1.56
SND1Q04007 RKM3YBR030W 1659 nt5.28□□□□□ -1.56
SND1Q04007 SLM5YCR024C 1479 nt5.28□□□□□ -1.56
SND1Q04007 COQ4YDR204W 1008 nt5.28□□□□□ -1.56
SND1Q04007 ERD1YDR414C 1089 nt5.28□□□□□ -1.56
SND1Q04007 ARC1YGL105W 1131 nt5.28□□□□□ -1.56
SND1Q04007 YGL258W-AYGL258W-A 234 nt5.28□□□□□ -1.56
SND1Q04007 BGL2YGR282C 942 nt5.28□□□□□ -1.56
SND1Q04007 ATP14YLR295C 375 nt5.28□□□□□ -1.56
SND1Q04007 CPR3YML078W 549 nt5.28□□□□□ -1.56
SND1Q04007 SEC65YML105C 822 nt5.28□□□□□ -1.56
SND1Q04007 ATG8YBL078C 354 nt5.28□□□□□ -1.56
SND1Q04007 YPL062WYPL062W 405 nt5.28□□□□□ -1.56
SND1Q04007 IOC4YMR044W 1428 nt5.28□□□□□ -1.56
SND1Q04007 YOR1YGR281W 4434 nt5.28□□□□□ -1.56
SND1Q04007 KAR5YMR065W 1515 nt5.28□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 17.7 ms