Protein–RNA interactions for Protein: Q03518

TAP1, Antigen peptide transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 808 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAP1Q03518 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TAP1Q03518 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TAP1Q03518 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TAP1Q03518 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
TAP1Q03518 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TAP1Q03518 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TAP1Q03518 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TAP1Q03518 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TAP1Q03518 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
TAP1Q03518 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
TAP1Q03518 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TAP1Q03518 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TAP1Q03518 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
TAP1Q03518 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TAP1Q03518 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TAP1Q03518 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TAP1Q03518 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TAP1Q03518 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TAP1Q03518 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TAP1Q03518 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TAP1Q03518 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
TAP1Q03518 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TAP1Q03518 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TAP1Q03518 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TAP1Q03518 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
TAP1Q03518 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
TAP1Q03518 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
TAP1Q03518 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TAP1Q03518 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TAP1Q03518 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TAP1Q03518 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TAP1Q03518 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TAP1Q03518 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TAP1Q03518 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TAP1Q03518 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TAP1Q03518 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
TAP1Q03518 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TAP1Q03518 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TAP1Q03518 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TAP1Q03518 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TAP1Q03518 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
TAP1Q03518 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
TAP1Q03518 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TAP1Q03518 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
TAP1Q03518 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
TAP1Q03518 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
TAP1Q03518 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
TAP1Q03518 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
TAP1Q03518 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
TAP1Q03518 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TAP1Q03518 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TAP1Q03518 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
TAP1Q03518 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TAP1Q03518 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TAP1Q03518 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TAP1Q03518 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TAP1Q03518 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TAP1Q03518 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
TAP1Q03518 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TAP1Q03518 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
TAP1Q03518 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TAP1Q03518 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TAP1Q03518 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TAP1Q03518 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TAP1Q03518 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TAP1Q03518 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TAP1Q03518 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TAP1Q03518 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TAP1Q03518 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TAP1Q03518 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TAP1Q03518 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TAP1Q03518 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TAP1Q03518 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
TAP1Q03518 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TAP1Q03518 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TAP1Q03518 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TAP1Q03518 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TAP1Q03518 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TAP1Q03518 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TAP1Q03518 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TAP1Q03518 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TAP1Q03518 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
TAP1Q03518 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TAP1Q03518 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TAP1Q03518 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
TAP1Q03518 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TAP1Q03518 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TAP1Q03518 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TAP1Q03518 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TAP1Q03518 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TAP1Q03518 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TAP1Q03518 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TAP1Q03518 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TAP1Q03518 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TAP1Q03518 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TAP1Q03518 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TAP1Q03518 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TAP1Q03518 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TAP1Q03518 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TAP1Q03518 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms