Protein–RNA interactions for Protein: Q02318

CYP27A1, Sterol 26-hydroxylase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP27A1Q02318 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CYP27A1Q02318 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CYP27A1Q02318 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CYP27A1Q02318 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CYP27A1Q02318 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CYP27A1Q02318 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CYP27A1Q02318 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CYP27A1Q02318 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CYP27A1Q02318 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CYP27A1Q02318 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CYP27A1Q02318 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CYP27A1Q02318 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CYP27A1Q02318 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CYP27A1Q02318 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CYP27A1Q02318 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CYP27A1Q02318 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CYP27A1Q02318 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CYP27A1Q02318 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CYP27A1Q02318 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CYP27A1Q02318 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CYP27A1Q02318 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CYP27A1Q02318 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CYP27A1Q02318 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CYP27A1Q02318 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CYP27A1Q02318 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CYP27A1Q02318 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CYP27A1Q02318 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CYP27A1Q02318 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CYP27A1Q02318 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CYP27A1Q02318 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CYP27A1Q02318 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CYP27A1Q02318 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CYP27A1Q02318 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CYP27A1Q02318 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CYP27A1Q02318 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CYP27A1Q02318 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CYP27A1Q02318 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CYP27A1Q02318 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CYP27A1Q02318 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CYP27A1Q02318 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CYP27A1Q02318 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CYP27A1Q02318 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CYP27A1Q02318 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CYP27A1Q02318 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CYP27A1Q02318 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CYP27A1Q02318 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CYP27A1Q02318 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CYP27A1Q02318 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CYP27A1Q02318 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CYP27A1Q02318 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CYP27A1Q02318 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CYP27A1Q02318 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CYP27A1Q02318 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CYP27A1Q02318 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CYP27A1Q02318 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CYP27A1Q02318 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CYP27A1Q02318 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CYP27A1Q02318 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CYP27A1Q02318 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CYP27A1Q02318 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CYP27A1Q02318 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CYP27A1Q02318 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CYP27A1Q02318 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CYP27A1Q02318 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CYP27A1Q02318 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CYP27A1Q02318 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CYP27A1Q02318 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CYP27A1Q02318 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CYP27A1Q02318 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CYP27A1Q02318 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CYP27A1Q02318 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CYP27A1Q02318 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CYP27A1Q02318 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CYP27A1Q02318 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CYP27A1Q02318 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CYP27A1Q02318 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CYP27A1Q02318 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CYP27A1Q02318 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CYP27A1Q02318 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CYP27A1Q02318 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CYP27A1Q02318 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CYP27A1Q02318 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CYP27A1Q02318 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CYP27A1Q02318 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CYP27A1Q02318 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CYP27A1Q02318 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CYP27A1Q02318 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CYP27A1Q02318 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CYP27A1Q02318 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CYP27A1Q02318 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CYP27A1Q02318 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CYP27A1Q02318 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CYP27A1Q02318 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CYP27A1Q02318 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CYP27A1Q02318 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CYP27A1Q02318 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CYP27A1Q02318 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CYP27A1Q02318 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CYP27A1Q02318 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CYP27A1Q02318 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms