Protein–RNA interactions for Protein: Q01831

XPC, DNA repair protein complementing XP-C cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 940 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPCQ01831 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
XPCQ01831 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
XPCQ01831 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC31.04■■■□□ 2.56
XPCQ01831 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
XPCQ01831 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
XPCQ01831 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC31.03■■■□□ 2.56
XPCQ01831 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC31.03■■■□□ 2.56
XPCQ01831 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
XPCQ01831 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
XPCQ01831 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
XPCQ01831 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
XPCQ01831 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
XPCQ01831 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC31.01■■■□□ 2.55
XPCQ01831 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
XPCQ01831 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
XPCQ01831 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC31■■■□□ 2.55
XPCQ01831 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
XPCQ01831 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
XPCQ01831 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC31■■■□□ 2.55
XPCQ01831 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
XPCQ01831 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
XPCQ01831 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
XPCQ01831 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
XPCQ01831 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
XPCQ01831 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
XPCQ01831 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
XPCQ01831 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC30.99■■■□□ 2.55
XPCQ01831 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
XPCQ01831 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
XPCQ01831 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
XPCQ01831 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
XPCQ01831 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
XPCQ01831 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
XPCQ01831 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
XPCQ01831 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
XPCQ01831 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
XPCQ01831 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
XPCQ01831 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC30.97■■■□□ 2.55
XPCQ01831 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
XPCQ01831 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
XPCQ01831 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
XPCQ01831 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
XPCQ01831 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
XPCQ01831 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
XPCQ01831 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
XPCQ01831 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
XPCQ01831 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC30.97■■■□□ 2.55
XPCQ01831 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
XPCQ01831 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
XPCQ01831 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
XPCQ01831 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
XPCQ01831 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
XPCQ01831 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
XPCQ01831 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
XPCQ01831 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
XPCQ01831 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
XPCQ01831 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
XPCQ01831 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
XPCQ01831 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
XPCQ01831 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
XPCQ01831 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.54
XPCQ01831 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
XPCQ01831 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
XPCQ01831 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
XPCQ01831 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
XPCQ01831 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
XPCQ01831 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
XPCQ01831 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.94■■■□□ 2.54
XPCQ01831 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC30.94■■■□□ 2.54
XPCQ01831 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
XPCQ01831 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
XPCQ01831 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
XPCQ01831 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC30.94■■■□□ 2.54
XPCQ01831 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
XPCQ01831 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
XPCQ01831 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
XPCQ01831 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
XPCQ01831 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
XPCQ01831 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
XPCQ01831 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
XPCQ01831 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
XPCQ01831 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
XPCQ01831 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
XPCQ01831 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
XPCQ01831 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
XPCQ01831 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
XPCQ01831 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
XPCQ01831 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
XPCQ01831 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
XPCQ01831 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
XPCQ01831 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
XPCQ01831 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
XPCQ01831 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
XPCQ01831 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC30.91■■■□□ 2.54
XPCQ01831 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
XPCQ01831 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
XPCQ01831 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
XPCQ01831 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
XPCQ01831 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
XPCQ01831 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms