Protein–RNA interactions for Protein: Q00889

PSG6, Pregnancy-specific beta-1-glycoprotein 6, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSG6Q00889 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PSG6Q00889 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PSG6Q00889 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PSG6Q00889 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PSG6Q00889 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PSG6Q00889 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PSG6Q00889 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PSG6Q00889 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PSG6Q00889 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PSG6Q00889 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PSG6Q00889 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PSG6Q00889 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PSG6Q00889 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PSG6Q00889 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PSG6Q00889 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PSG6Q00889 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
PSG6Q00889 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PSG6Q00889 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PSG6Q00889 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PSG6Q00889 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PSG6Q00889 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PSG6Q00889 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PSG6Q00889 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PSG6Q00889 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PSG6Q00889 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PSG6Q00889 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
PSG6Q00889 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PSG6Q00889 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PSG6Q00889 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PSG6Q00889 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PSG6Q00889 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PSG6Q00889 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PSG6Q00889 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PSG6Q00889 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PSG6Q00889 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PSG6Q00889 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PSG6Q00889 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PSG6Q00889 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.92
PSG6Q00889 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PSG6Q00889 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PSG6Q00889 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PSG6Q00889 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
PSG6Q00889 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PSG6Q00889 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PSG6Q00889 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PSG6Q00889 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PSG6Q00889 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PSG6Q00889 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
PSG6Q00889 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PSG6Q00889 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PSG6Q00889 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PSG6Q00889 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PSG6Q00889 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PSG6Q00889 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PSG6Q00889 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PSG6Q00889 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PSG6Q00889 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
PSG6Q00889 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PSG6Q00889 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PSG6Q00889 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PSG6Q00889 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PSG6Q00889 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PSG6Q00889 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PSG6Q00889 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PSG6Q00889 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PSG6Q00889 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PSG6Q00889 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PSG6Q00889 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PSG6Q00889 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PSG6Q00889 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PSG6Q00889 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PSG6Q00889 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PSG6Q00889 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PSG6Q00889 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PSG6Q00889 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PSG6Q00889 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PSG6Q00889 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PSG6Q00889 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PSG6Q00889 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PSG6Q00889 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PSG6Q00889 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
PSG6Q00889 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PSG6Q00889 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PSG6Q00889 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PSG6Q00889 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PSG6Q00889 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PSG6Q00889 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PSG6Q00889 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PSG6Q00889 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PSG6Q00889 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
PSG6Q00889 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
PSG6Q00889 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PSG6Q00889 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PSG6Q00889 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PSG6Q00889 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PSG6Q00889 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PSG6Q00889 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PSG6Q00889 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PSG6Q00889 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PSG6Q00889 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms