Protein–RNA interactions for Protein: Q00610

CLTC, Clathrin heavy chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCQ00610 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
CLTCQ00610 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
CLTCQ00610 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
CLTCQ00610 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
CLTCQ00610 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
CLTCQ00610 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
CLTCQ00610 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
CLTCQ00610 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
CLTCQ00610 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
CLTCQ00610 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
CLTCQ00610 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
CLTCQ00610 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
CLTCQ00610 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
CLTCQ00610 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
CLTCQ00610 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
CLTCQ00610 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
CLTCQ00610 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
CLTCQ00610 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
CLTCQ00610 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC33.32■■■□□ 2.92
CLTCQ00610 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
CLTCQ00610 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
CLTCQ00610 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
CLTCQ00610 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
CLTCQ00610 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
CLTCQ00610 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
CLTCQ00610 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
CLTCQ00610 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
CLTCQ00610 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
CLTCQ00610 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
CLTCQ00610 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
CLTCQ00610 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
CLTCQ00610 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
CLTCQ00610 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
CLTCQ00610 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
CLTCQ00610 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
CLTCQ00610 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
CLTCQ00610 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
CLTCQ00610 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
CLTCQ00610 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
CLTCQ00610 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC33.29■■■□□ 2.92
CLTCQ00610 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
CLTCQ00610 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
CLTCQ00610 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
CLTCQ00610 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
CLTCQ00610 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
CLTCQ00610 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
CLTCQ00610 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
CLTCQ00610 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
CLTCQ00610 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
CLTCQ00610 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
CLTCQ00610 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.29■■■□□ 2.92
CLTCQ00610 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
CLTCQ00610 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC33.29■■■□□ 2.92
CLTCQ00610 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
CLTCQ00610 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
CLTCQ00610 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
CLTCQ00610 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
CLTCQ00610 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC33.27■■■□□ 2.92
CLTCQ00610 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC33.27■■■□□ 2.92
CLTCQ00610 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
CLTCQ00610 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC33.27■■■□□ 2.92
CLTCQ00610 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
CLTCQ00610 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
CLTCQ00610 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
CLTCQ00610 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
CLTCQ00610 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.91
CLTCQ00610 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
CLTCQ00610 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
CLTCQ00610 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
CLTCQ00610 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
CLTCQ00610 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
CLTCQ00610 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC33.25■■■□□ 2.91
CLTCQ00610 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.25■■■□□ 2.91
CLTCQ00610 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
CLTCQ00610 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
CLTCQ00610 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
CLTCQ00610 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
CLTCQ00610 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
CLTCQ00610 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
CLTCQ00610 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
CLTCQ00610 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
CLTCQ00610 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
CLTCQ00610 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
CLTCQ00610 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
CLTCQ00610 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.24■■■□□ 2.91
CLTCQ00610 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
CLTCQ00610 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
CLTCQ00610 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
CLTCQ00610 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
CLTCQ00610 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
CLTCQ00610 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
CLTCQ00610 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
CLTCQ00610 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
CLTCQ00610 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
CLTCQ00610 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC33.23■■■□□ 2.91
CLTCQ00610 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
CLTCQ00610 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
CLTCQ00610 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
CLTCQ00610 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
CLTCQ00610 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms